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Jfreda鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
gromacs中的一些問題
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大家好，我有幾個(gè)問題想向你們請(qǐng)教一下。 1.gromacs對(duì)體系升溫的時(shí)候有必要對(duì)磷脂進(jìn)行限制嗎？蛋白和小分子分別進(jìn)行了限制。 2.在NVT條件下升溫的時(shí)候，tcoupl設(shè)為v-rescale,升溫結(jié)束之后，在NTP條件下，放開限制性模擬，tcoupl是否可以設(shè)為Nose-Hoover，pcoupl是設(shè)為berendsen還是Parrinello-Rahman，然后接下去的NTP條件下無限制性平衡模擬和MD，這些參數(shù)是不是都不需要改了？謝謝！ |
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Jfreda
鐵蟲 (小有名氣)
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2樓2011-04-28 20:10:49
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