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meteoric30木蟲 (正式寫手)
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[求助]
計算orbital composition
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我簡單計算了甲醇的單點能 基組6-31g** pop=reg得到 Molecular Orbital Coefficients 5 6 7 8 9 (A)--O (A)--O (A)--O (A)--O (A)--O EIGENVALUES -- -0.50123 -0.43327 -0.41890 -0.32941 -0.26492 1 1 C 1S 0.02599 0.00000 -0.00543 0.01363 0.00000 2 2S -0.04962 0.00001 0.01119 -0.03358 0.00000 3 2PX -0.23161 0.00004 -0.27326 0.11697 0.00000 4 2PY 0.21363 0.00003 -0.30666 -0.26989 0.00001 5 2PZ 0.00001 0.42015 0.00004 0.00000 -0.17876 6 3S -0.05786 0.00002 0.02227 -0.03258 0.00000 7 3PX -0.07912 0.00002 -0.11207 0.03513 0.00000 8 3PY 0.09332 0.00000 -0.15399 -0.07930 0.00000 9 3PZ -0.00001 0.17326 0.00003 0.00000 -0.02244 10 4XX 0.02178 0.00000 0.01845 -0.00832 0.00000 11 4YY -0.00188 -0.00002 -0.02006 -0.00488 0.00002 12 4ZZ -0.01434 0.00002 0.00052 0.01518 -0.00002 13 4XY -0.00986 0.00000 -0.00836 -0.02462 0.00000 14 4XZ 0.00000 0.00249 0.00000 0.00000 -0.03162 15 4YZ -0.00001 -0.01587 0.00002 0.00002 0.01328 16 2 H 1S 0.02750 -0.00013 -0.23672 -0.17711 0.00011 17 2S 0.01577 -0.00009 -0.18684 -0.18524 0.00015 18 3PX -0.00412 0.00000 0.00113 0.00336 0.00000 19 3PY 0.00185 0.00001 0.00617 0.00333 -0.00001 20 3PZ 0.00000 0.00779 -0.00001 -0.00001 -0.00486 21 3 H 1S -0.11948 -0.20300 0.03706 0.11400 0.14852 22 2S -0.07696 -0.17200 0.02421 0.13849 0.19822 23 3PX -0.00066 0.00461 -0.00480 0.00065 0.00034 24 3PY 0.00006 -0.00539 -0.00425 -0.00360 0.00311 25 3PZ -0.00584 -0.00226 0.00174 0.00534 0.00115 26 4 H 1S -0.11936 0.20314 0.03689 0.11378 -0.14863 27 2S -0.07687 0.17210 0.02406 0.13825 -0.19837 28 3PX -0.00066 -0.00461 -0.00480 0.00065 -0.00034 29 3PY 0.00007 0.00539 -0.00425 -0.00361 -0.00311 30 3PZ 0.00584 -0.00227 -0.00174 -0.00533 0.00116 31 5 O 1S -0.03947 0.00000 0.03131 -0.06665 0.00000 32 2S 0.09216 0.00000 -0.05801 0.12995 0.00000 33 2PX 0.28346 -0.00003 0.34108 -0.19977 0.00000 34 2PY 0.31776 0.00001 -0.12932 0.42084 0.00000 35 2PZ 0.00000 0.25642 0.00003 0.00001 0.59486 36 3S 0.14668 0.00001 -0.14062 0.32712 -0.00001 37 3PX 0.12762 -0.00002 0.19338 -0.14321 0.00000 38 3PY 0.16321 0.00001 -0.08316 0.28146 0.00000 39 3PZ 0.00000 0.16208 0.00002 0.00000 0.45628 40 4XX 0.01207 0.00000 0.00965 -0.00899 0.00000 41 4YY -0.02116 0.00000 0.00558 -0.03088 0.00000 42 4ZZ 0.00150 0.00000 0.00106 -0.00012 0.00000 43 4XY 0.00010 0.00000 -0.02405 0.00764 0.00000 44 4XZ 0.00000 0.01420 0.00000 0.00000 0.00830 45 4YZ 0.00000 -0.01107 0.00000 0.00000 -0.02046 46 6 H 1S -0.21191 0.00001 -0.04498 -0.15220 0.00000 47 2S -0.13754 0.00000 -0.04682 -0.12187 0.00001 48 3PX -0.00194 0.00000 0.01073 -0.01014 0.00000 49 3PY -0.01180 0.00000 -0.00761 0.00213 0.00000 50 3PZ 0.00000 0.00855 0.00000 0.00000 0.01974 可是如何才能得到原子或者基團在HOMO LUMO中所占百分比？ 如看文獻中 Ru HOMO 25.3% NSC 32.8% LOMO 6.96% 0.727% |
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我用甲烷分子簡略的做了一下HOMO分析：它的HOMO是第５個軌道 Molecular Orbital Coefficients 1 2 3 4 5 (A1)--O (A1)--O (T2)--O (T2)--O (T2)--O EIGENVALUES -- -10.14326-0.70258-0.39844-0.39844-0.39844 1 1 C1S 0.56289-0.10958 0.00000 0.00000 0.00000 2 2S 0.46308-0.16939 0.00000 0.00000 0.00000 3 2PX 0.00000 0.00000 0.20725 0.00000 0.00000 4 2PY 0.00000 0.00000 0.00000 0.00000 0.20725 5 2PZ 0.00000 0.00000 0.00000 0.20725 0.00000 6 3S 0.02002 0.43848 0.00000 0.00000 0.00000 7 3PX 0.00000 0.00000 0.29256 0.00000 0.00000 8 3PY 0.00000 0.00000 0.00000 0.00000 0.29256 9 3PZ 0.00000 0.00000 0.00000 0.29256 0.0000010 4S -0.00309 0.25481 0.00000 0.00000 0.00000（后面的就不貼出來了） 我把第HOMO（第５列）的所有數(shù)平方后求和，然后分辨把1C，2H，3H，4H，5H的軌道的平方和除以HOMO（第5列）的所有系數(shù)的平方和，從而得到各原子在甲烷分子的HOMO中所占比例： 1C占了0.527013397 2H占了0.118246651 3H占了0.118246651 4H占了0.118246651 5H占了0.118246651請教大俠們，具體是不是這樣算的？ 大俠， 這樣對嗎？ 我做了 pop=nbo，但是輸出文件中如何才能得到homo中每個原子的所占的比例呢？ 請大俠指明。 |
4樓2011-05-26 11:29:43
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