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p120933799金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
DNA溶解小問(wèn)
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| 我用CTAB方法提取真菌DNA,基本上是嚴(yán)格按照操作,可最后加TE后總有不溶解透明物質(zhì),在65℃下也不溶解,請(qǐng)問(wèn)為何?如何可避免,以往也遇到很多這種情況, |

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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采用冷凍研磨CTAB法提取樣品基因組DNA。 (1)從斜面培養(yǎng)基中接入一定量的孢子至液體種子培養(yǎng)基中180rpm,28℃培養(yǎng)2天,用7mL的離心管離心收集菌體,用無(wú)菌水洗滌后充分晾干至-70℃冰箱保存。 (2)取0.5g干燥的菌絲體放入研缽中,用液氮磨碎至粉狀,轉(zhuǎn)移至7mLeppendorf離心管中。 (3)加入2mL 65℃預(yù)熱的2×CTAB 抽提液,顛倒混勻,65℃保溫30min,每隔數(shù)分鐘溫和混勻一次。 (4)加入2mL的氯仿/異戊醇(24:1),輕緩顛倒混勻,室溫靜置5~10min ,10000rpm離心5min。 (5)取上清約2mL轉(zhuǎn)至另一干凈的eppendorf離心管中(注意不要吸出有機(jī)相),加入200uL 65℃預(yù)熱的CTAB/ NaCl 溶液,輕緩顛倒混勻。 (6)加入等體積的氯仿/異戊醇(24:1)抽提液,混勻,10000rpm離心5min。 (7)取上清700uL至另一干凈的eppendorf離心管中(注意不要吸出有機(jī)相),加入等體積的 CTAB沉淀液,顛倒混勻,65℃保溫30min。 (8)4℃,5000rpm離心5min。 (9)倒去上清,用濾紙吸干殘液,加入500uL 高鹽TE緩沖液重懸沉淀,65℃保溫30min,直至完全溶解。 (10)加入300 uL的異丙醇沉淀核酸,充分混勻,4℃,10000rpm離心15min。 (11)倒去上清,用80%乙醇洗滌沉淀,用濾紙吸干殘液,在超凈工作臺(tái)中室溫下自然干燥。 (12)加入100uL含RNA酶的TE緩沖液重懸,42℃水浴30min。 以0.7%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)基因組DNA大小及提取質(zhì)量;紫外分光光度計(jì)法檢測(cè)DNA純度(將DNA稀釋100倍后分別測(cè)OD260和OD280,并計(jì)算OD260/ OD280的比值) 這是我做的步驟,溶解不了是不是最后搞的太干了~這種情況應(yīng)該是很少的~ |
專(zhuān)家顧問(wèn) (知名作家)
生物大分子降解酶
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專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn): +248 |
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CTAB法太繁瑣了,看我的 2.4.14.1真菌總DNA的提取 (1)接種菌株至液體培養(yǎng)基中,28℃,180rpm振蕩培養(yǎng)3天; (2)用滅菌紗布過(guò)濾,并壓干菌體; (3)將菌絲體倒入研缽(滅菌并預(yù)冷),迅速倒入液氮,研磨至粉末狀; (4)將粉末移至1.5mL的EP管中,加入600µL真菌提取液; (5)加等體積苯酚/氯仿,輕輕倒轉(zhuǎn)混合,10000rpm離心10min; (6)取400µL上清液移入新的1.5mlLEP管,重復(fù)步驟(5); (7)取上清液,加入兩倍體積無(wú)水乙醇,-20℃放置30min; (8)10000rpm 離心10min,75%乙醇洗沉淀2次,真空干燥; (9)以20µL 1×TE 溶解沉淀; (10)電泳檢測(cè)總DNA的濃度。 (5)DNA抽提液的配置 表 2.5 DNA抽提液的配置 成分 濃度 NaCl 200mmol/L EDTA-Na2 4mmol/L SDS 2% Tris-HCl(pH=8.0) 100mmol/L |

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