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[交流]
那些基因可以反映組織內(nèi)ATP的濃度?
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| 如果細(xì)胞內(nèi)ATP合成途徑中某部分受阻,ATP含量下降,那些基因可以被ATP減少所誘導(dǎo),迅速反映出這種變化呢?就想Mt4基因可以受到磷酸鹽濃度的影響,作為一種指示基因,那些可以作為ATP的指示基因? |
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我覺得應(yīng)該這樣理解這個(gè)問題,ATP是所有細(xì)胞必須的,相關(guān)基因可能是管家基因。管家基因表達(dá)水平受環(huán)境因素影響較小,而是在個(gè)體各個(gè)生長(zhǎng)階段的大多數(shù)、或幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小。它的表達(dá)只受啟動(dòng)序列或啟動(dòng)子與RNA聚合酶相互作用的影響,而不受其他機(jī)制調(diào)節(jié)。 我的說法只是一個(gè)猜測(cè)。請(qǐng)專家回答這個(gè)深度問題。 |
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你腫么老想著轉(zhuǎn)錄水平變化呢 1,這個(gè)問題看起來很復(fù)雜。從ATP合成機(jī)制上看,無論是底物水平磷酸化,還是氧化磷酸化的ATP合成酶合成ATP,這些相關(guān)基因在組織細(xì)胞內(nèi)表達(dá)不會(huì)受環(huán)境變化而變化。之所以這么想,是因?yàn)槠咸烟、脂肪降解是ATP的最終來源。最終實(shí)現(xiàn)ATP或者NADH、FADH2轉(zhuǎn)化的是糖酵解、TCA、脂肪氧化進(jìn)入TCA。沒有考證TCA各個(gè)酶受誘導(dǎo)情況,但是我覺得,這些基因的表達(dá),不受外界信號(hào)變化而變化。 2,你說的加一些抑制劑,解偶聯(lián)劑,解除氧化磷酸化歐聯(lián)從而降低ATP合成,ATP合成減少,隨著ATP被利用,ADP增多,肯定會(huì)引起組織細(xì)胞一些列變化,但我了解到的都是生理生化上的變化。比如線粒體的緊縮態(tài)和活動(dòng)態(tài)的轉(zhuǎn)變。但是好像沒有進(jìn)一步誘導(dǎo)ATP合酶、NADH、FADH2氧化磷酸化電子傳遞鏈蛋白對(duì)應(yīng)的這些管家基因的變化。 3,ATP好像與第二信使cAMP信號(hào)傳導(dǎo)除了底物與產(chǎn)物的關(guān)系,并沒有信號(hào)上的關(guān)系。 總結(jié): 1,無論是糖酵解、TCA、脂肪氧化,還是ATP合酶、電子遞鏈蛋白系統(tǒng)、cAMP。細(xì)胞生理生化變化,轉(zhuǎn)錄水平好像沒有什么變化。 2,ATP減少會(huì)引起葡萄糖、脂肪的加速降解,但是資料上找不到轉(zhuǎn)錄水平的變化。 3,水平有限,期待高手。 |
榮譽(yù)版主 (知名作家)
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ATP不清楚,個(gè)人認(rèn)為應(yīng)該是有不少基因受ATP濃度影響的。 剛試了下google“ATP-dependent gene"有不少結(jié)果,樓主可以試試。 可以在相關(guān)文獻(xiàn)中查找“ATP level”,看看別人是怎么確定"ATP level"的,如果用的是某些基因的表達(dá)量(熒光定量PCR或者Western Blot”的結(jié)果),那么這些基因就是樓主需要的啦。 外行意見,僅供參考 ![]() [ Last edited by 西瓜 on 2011-6-18 at 10:39 ] |
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1,細(xì)胞質(zhì)的ATP水平是細(xì)胞凋亡或壞死的一個(gè)重要因素,當(dāng)ATP低于某個(gè)水平時(shí),細(xì)胞就會(huì)激活凋亡機(jī)制。(細(xì)胞凋亡家族基因相關(guān))。細(xì)胞凋亡時(shí),需要葡萄糖分解保持較高的ATP水平(激光誘導(dǎo)癌細(xì)胞凋亡) 2,抑制底物水平磷酸化、氧化磷酸化(魚藤酮、放線菌素D、寡霉素),ATP水平下降,細(xì)胞3h內(nèi)啟動(dòng)凋亡機(jī)制。當(dāng)超過8h,細(xì)胞就會(huì)通過凋亡而死亡。ATP水平進(jìn)一步下降,細(xì)胞不是通過凋亡或者谷氨酸誘導(dǎo)的凋亡機(jī)制死亡,而是直接破裂壞死(氰化鉀)。 3,ATP通過激活轉(zhuǎn)錄抑制子抑制基因的表達(dá)。這個(gè)過程是可逆的。當(dāng)ATP量減少時(shí),相關(guān)基因表達(dá)。 4,ATP可以激活NF-kB信號(hào)體系,啟動(dòng)免疫應(yīng)答和炎癥反應(yīng)。 5,線粒體中,基因轉(zhuǎn)錄通過ATP sensing 機(jī)制調(diào)節(jié)。 6,ATP水平影響固氮酶的開啟和關(guān)閉。 零零碎碎查了一些文獻(xiàn),希望有更多的補(bǔ)充~~~~~ |


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