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lilirong2009銅蟲(chóng) (小有名氣)
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細(xì)菌基因組DNA提取問(wèn)題
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1.挑單菌落于3ml培養(yǎng)基中,37℃過(guò)夜培養(yǎng) 2.取3ml菌液于EP管中8000rmp/min離心2min,收集菌體。 3、加100ulTE重懸菌體(儀器:漩渦振蕩器)8000 rpm/min離心 2min。 4、去上清,注意吸干多余的水分,沉淀物加入50ulTE緩沖液,反復(fù)吹打重懸菌體,加入50ul溶菌酶,混勻后37℃水浴30min 5加入460ulTE,加入30ul 10%SDS,混勻,加入蛋白酶K3ul,37℃溫浴30min以上直到溶液變澄清。澄清后,加入200ul 5mol/l的NaCl,充分混勻后,再加入預(yù)熱好的200ul CTAB/NaCl溶液,混勻后65℃溫浴30min 6.10000rpm/min離心5min取上清后后再加入等體積的氯仿異戊醇,混勻,12000rpm/min離心5min取上清,重復(fù)上次操作。直至界面不出現(xiàn)蛋白凝膠為止。 7.加入等體積Tris飽和酚/氯仿/異戊醇(25/24/1)。充分混勻后,12000r/min離心5min,吸取上清。重復(fù)上次操作。直至界面不出現(xiàn)蛋白凝膠為止。 8、小心取出上清用預(yù)冷兩倍體積的無(wú)水乙醇沉淀,在冰上放置1-2h或放冰箱凍存1-2h,沉淀后,再以12000rpm/min離心10min。 9、用500μL 70%的乙醇洗滌兩次,每次12000rmp/min離心2min,然后倒掉上清液(一定要倒扣離心管足夠長(zhǎng)的時(shí)間,是乙醇盡可能流干凈,否則不易風(fēng)干)。 10、真空干燥后,用50μLTE或超純水溶解DNA,-20℃冰箱放置備用 我用這個(gè)方法提取的基因組DNA,以前怎么提取都沒(méi)問(wèn)題,但是最近提取總是降解,混勻的時(shí)候已經(jīng)很輕了但是還是降解,還有其他導(dǎo)致降解的原因嗎?后來(lái)我用試劑盒提取也降解,這和氣溫高有關(guān)系嗎?操作的時(shí)候需要在冰上否?另外配好的Tris飽和酚/氯仿/異戊醇(25/24/1)溶液放在冰箱里是分層用的時(shí)候要混勻再用嗎? |
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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