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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 綜合其他 » 長片段測序
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1949stone榮譽版主 (知名作家)
海納百川
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[求助]
長片段測序
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長片段測序的方法有哪些好一點（性價比最好的） 可以提供幾個公司么？ 片段大概有13000bp左右 沒有特殊結(jié)構 就是線粒體的一部分 謝謝了 |
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1949stone
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7樓2011-07-05 10:42:25
gwbk
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【答案】應助回帖
★ ★ ★
1949stone(金幣+4): 我想知道長片段測序呢 1萬多的片段 2011-07-04 16:43:09
dhd997(金幣+3): good 2011-07-04 18:03:02
1949stone(金幣+4): 我想知道長片段測序呢 1萬多的片段 2011-07-04 16:43:09
dhd997(金幣+3): good 2011-07-04 18:03:02
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生工和金斯瑞標稱都是用的ABI-PRISM3730，號稱國際先進： 我的生工測序說明，序列長度5000bp做定點。 測序結(jié)果：與NCBI序列完全相同（定點突變除外）。 測序時，由于熒光染料的干擾，測序結(jié)果在引物3'端后面的10至30個，嚴重時可能達到70個以上堿基不一定能夠準確判讀，需您根據(jù)自己的已知序列信息及測序彩圖作出判斷。 所用測序儀器為ABI-PRISM3730，測序試劑為BigDyeterminator v3.1。ABI公司對儀器的性能說明為：正常情況下，除了開始約10至30個堿基，在650bp以內(nèi)可以達到98.5%以上的準確率，但儀器及軟件有時也會發(fā)生錯讀或漏讀堿基的情況，此時需要您自己判斷具體是什么堿基。所以，一般只有進行正反鏈同時測序，在兩個序列完全吻合的情況下，才能確保所得序列100%可靠。單靠一個方向測序得到完全準確的序列是幾乎不可能的，這是由儀器本身的性能指標決定的。 正常情況下，一個測序反應可以得到800bp以上，但一般在700bp以后的序列只能作為參考。 也可以考慮華大基因，以前聯(lián)系過，￥50000測4M的基因組，性價比較高，還附帶基因組標注，大片段是他們的強項。 |
2樓2011-07-04 15:56:07
beautybanana
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3樓2011-07-04 15:56:39
4樓2011-07-04 16:36:08
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