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fghostyun6新蟲 (初入文壇)
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[交流]
基因芯片數(shù)據(jù)生物學(xué)分析結(jié)果，大家?guī)臀铱纯矗? 已有3人參與
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最近讓 biopharm soft公司幫我做了一個(gè)基因芯片的結(jié)果生物學(xué)意義分析，部分內(nèi)容如下：（我想問的是GOID是什么？ Count他們告訴我是指富集分析的頻數(shù)，怎么理解？） Gene GO GOID A2ML1 protein binding GO:5515 A2ML1 regulation of endopeptidase activity GO:52548 A2ML1 serine-type endopeptidase inhibitor activity GO:4867 ABCD1 ATP binding GO:5524 ABCD1 ATPase activity GO:16887 ABCD1 ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances GO:42626 ABCD1 identical protein binding GO:42802 ABCD1 integral to membrane GO:16021 ..... 他們還幫我分析了前10個(gè)最重要的基因功能，也是類似的結(jié)果： GO COUNT protein binding 325 nucleus 198 cytoplasm 185 regulation of transcription, DNA-dependent 163 |
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cdl007
木蟲 (正式寫手)
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西瓜(金幣+3): 鼓勵(lì)應(yīng)助！ 2011-07-07 22:44:18
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西瓜(金幣+3): 鼓勵(lì)應(yīng)助！ 2011-07-07 22:44:18
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go 是一個(gè)很好用的數(shù)據(jù)庫，gene ontology 翻譯成漢語可以叫基因本源， 主頁 www.geneontology.org GOID就是 GO數(shù)據(jù)庫里的ID號(hào) count就是頻度，就是這個(gè)功能里有多少基因這種理解吧。。。不是很確定 最近在研究這個(gè)數(shù)據(jù) |
2樓2011-07-07 22:34:48
gayalynau
鐵桿木蟲 (著名寫手)
嗨
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3樓2011-07-09 18:07:01
fghostyun6
新蟲 (初入文壇)
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4樓2011-07-13 09:47:45
5樓2011-08-08 09:30:32
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