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dogone金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
過(guò)渡態(tài)的尋找
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這幾天比較郁悶，正在做一個(gè)金屬配合物的水解計(jì)算。先按照配合物是+3價(jià)進(jìn)行計(jì)算，工作很順利，已經(jīng)完成。因?yàn)樵撆浜衔镌谒鈺r(shí)有可能被還原。所以，我就想計(jì)算配合物被還原為+2價(jià)時(shí)的水解反應(yīng)過(guò)程。但是搗鼓了很久，也沒(méi)有得到好的結(jié)果，連反應(yīng)的過(guò)渡態(tài)都找不到。非常郁悶！ 我是這樣考慮的：（1）我直接把+3價(jià)配合物優(yōu)化后的構(gòu)型拿來(lái)，只電荷和自選多重度做相應(yīng)的改變，優(yōu)化后得到+2價(jià)配合物的結(jié)構(gòu)。然后進(jìn)行過(guò)渡態(tài)的尋找，總是出現(xiàn)問(wèn)題，不是跑成其他分子了，就是鍵拉的太長(zhǎng)，或有時(shí)虛頻太小，震動(dòng)方式也不對(duì)，都不是真正的過(guò)渡態(tài)。（2）我嘗試用+3配合物算好的過(guò)渡態(tài)的結(jié)構(gòu)，修改電荷和多重度，還是找不到+2價(jià)配合物水解反應(yīng)的過(guò)渡態(tài)，和1出現(xiàn)的問(wèn)題一樣。（3）我是用和+3價(jià)配合物計(jì)算一樣的方法和基組（B3LYP/LANL2DZ)。用過(guò)ST,QST2,QST3方法，都找不到+2價(jià)配合物水解反應(yīng)的過(guò)渡態(tài)。 我的疑問(wèn)是：難道+2價(jià)配合物水解反應(yīng)不存在，或者說(shuō)這個(gè)反應(yīng)不成立，但是，文獻(xiàn)中已經(jīng)有該類(lèi)配合物還原為+2價(jià)時(shí)的水解反應(yīng)的計(jì)算發(fā)表啊，不應(yīng)該啊？ 是不是適合+3價(jià)配合物的方法和基組對(duì)+2價(jià)配合物不適應(yīng)，但是如果換一種方法或者基組的話，計(jì)算出的結(jié)果和+3價(jià)的又沒(méi)有可比性。 放棄又不甘心，但是做了好久又沒(méi)有結(jié)果。真的非常郁悶！ 我知道論壇里面高手如云，我的問(wèn)題可能比較幼稚讓您見(jiàn)笑了。如果哪位同行能給我一點(diǎn)點(diǎn)建議，指點(diǎn)，或蛛絲馬跡的思路，我將不勝感激！ [ Last edited by dogone on 2011-7-19 at 10:44 ] |
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dogone
金蟲(chóng) (小有名氣)
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2樓2011-07-20 09:50:34
eaglesofei
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【答案】應(yīng)助回帖
dogone(金幣+3): 謝謝！我在認(rèn)真看看文獻(xiàn)。 2011-07-21 14:38:03
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1."因?yàn)樵撆浜衔镌谒鈺r(shí)有可能被還原".你在做+3價(jià)的時(shí)候，能否看出它的確被還原了？如果反應(yīng)進(jìn)程需要它還原，那么+2價(jià)的還能否還原（若不能，且反應(yīng)進(jìn)程需要它還原的話，估計(jì)就不行了）？ 2。已有文獻(xiàn)報(bào)到+2價(jià)的計(jì)算？你把它提供的SI找到，看看他們的過(guò)渡態(tài)像啥樣子，你再在他們的過(guò)渡態(tài)的基礎(chǔ)之上找吧，而不是直接從+3價(jià)的基礎(chǔ)來(lái)找 |
3樓2011-07-21 13:02:19
逍遙學(xué)生TT
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文獻(xiàn)的報(bào)道你可以考慮，不同的實(shí)驗(yàn)人員，做出的結(jié)果有可能不一樣，你再尋找一下過(guò)渡態(tài)！科研要持之以恒！ 4樓2011-07-22 11:11:53
遙遠(yuǎn)的樹(shù)
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5樓2011-07-22 11:24:15
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