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yanfeier金蟲 (小有名氣)
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[求助]
底物結(jié)構(gòu)式的分析
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這里有沒有人清楚： 如果用同一種酶去催化或者水解某些化學結(jié)構(gòu)式不同的糖苷，這些糖苷的結(jié)構(gòu)不同，會引起不同的水解效率，這不同的水解效率是有不同結(jié)構(gòu)式怎么引起的，有了解的給具體的分析一下吧。 比如β-D-葡萄糖苷和β-D-半乳糖苷，用同一種糖苷酶去水解他們的時候會有不同的水解效率，那這不同的水解效率是這兩種不同的糖苷不同結(jié)構(gòu)怎么起作用引起的。（是空間位阻或者什么，我自己不懂化學，可能問的比較啰嗦或不得當） 期待給為給予指導，謝謝 |
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金幣+5, MolEPI+1): good 2011-08-07 15:44:34
yanfeier(金幣+2): 2011-10-07 20:26:27
yanfeier(金幣+10): 2011-10-27 14:19:01
dhd997(金幣+5, MolEPI+1): good 2011-08-07 15:44:34
yanfeier(金幣+2): 2011-10-07 20:26:27
yanfeier(金幣+10): 2011-10-27 14:19:01
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還是沒人幫你啊~真糾結(jié)！ 怎么說呢，這個問題比較復雜的 1，β-D-葡萄糖苷和β-D-半乳糖苷是包含與被包含的意思；也就是說β-D-葡萄糖苷酶可以分為纖維二糖酶：Glcβ（1-4）Glc、龍膽二糖酶：Glcβ（1-6）Glc、半乳糖苷酶Galβ（1-4）Glc等等。有些α葡萄糖苷酶水解還原性末端葡萄糖如水解1，4-α-D-葡萄糖，同時具有水解1，6-α-D-葡萄糖特性；可以水解Glcα（1-4）Glc，也可以水解Galα（1-4）Glc等。 2，酶識別糖苷鍵，主要是通過識別不同的單糖分子、單糖在復合物中的構(gòu)象：呋喃型和吡喃型，α和β型來實現(xiàn)的，不同單糖分子、吡喃呋喃構(gòu)型就不多說了，α和β說一下：異頭碳的構(gòu)型對寡糖分子形狀影響很大，而分子形狀涉及能否被酶識別，例如催化麥芽糖（α糖苷鍵）和纖維二糖（β糖苷鍵）水解需要不同的酶，雖然兩者都是D-葡萄糖通過1-4連接的二聚體。 |
2樓2011-08-06 00:03:34
jinkui960
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金幣+5, MolEPI+1): good 2011-08-07 15:44:50
yanfeier(金幣+5): 2011-10-07 20:26:34
dhd997(金幣+5, MolEPI+1): good 2011-08-07 15:44:50
yanfeier(金幣+5): 2011-10-07 20:26:34
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根據(jù)我們做絲氨酸蛋白酶的經(jīng)驗，絲氨酸蛋白酶有四個底物結(jié)合口袋，這四個底物口袋分別和底物分子的不同原子發(fā)生作用，當同一種蛋白酶催化不同的底物分子的時候，底物分子的原子大小、電荷等性質(zhì)都決定了它是否能進入酶的底物結(jié)合口袋，和底物結(jié)合口袋最適合的底物能優(yōu)先和蛋白酶結(jié)合，蛋白酶對它的催化效率最高。 所以，針對你的問題： 如果用同一種酶去催化或者水解某些化學結(jié)構(gòu)式不同的糖苷，這些糖苷的結(jié)構(gòu)不同，確實會引起不同的水解效率，不同的水解效率是由不同底物的結(jié)構(gòu)引起的，底物分子的結(jié)構(gòu)決定了它是否能進入酶的底物結(jié)合口袋，從而發(fā)生催化反應。 酶的本質(zhì)是蛋白質(zhì)，它們的結(jié)構(gòu)是相對穩(wěn)定的，但是酶的結(jié)構(gòu)也有一定的柔性，酶的底物結(jié)合口袋也會發(fā)生一定的變化，從而提高催化效率！ |
3樓2011-08-06 00:47:56
gwbk
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【答案】應助回帖
yanfeier(金幣+3): 2011-10-07 20:26:40
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補充一點：關(guān)于催化機制 β半乳糖苷酶、溶菌酶屬于誘導契合型催化機制，同時也是廣義的酸堿催化，具體來說： 1，β半乳糖苷酶：在底物乳糖存在下，酶的熒光光譜發(fā)生顯著變化，這種變化是乳糖誘導引起的，酶蛋白的構(gòu)象改變有利于活性中心與底物的結(jié)合和催化反應的進行。 2，溶菌酶：可以容納6個糖殘基，其中第四個糖殘基D環(huán)因為空間的原因，必須由正常的椅式變形為能量較高的半椅式，糖苷鍵穩(wěn)定性降低，鍵由此斷裂。 3，廣義的酸堿催化：這個在水解反應中不難理解，通過H+或OH-以及能提供H+或OH-供體進行催化的反應稱為總酸堿催化，或者廣義酸堿催化。溶菌酶中，提供H+的是Glu。 4，β半乳糖苷酶：以半乳糖衍生物為參照，不同的配基與半乳糖苷酶結(jié)合引發(fā)的酶的構(gòu)象變化和底物形變是不同的，催化效率也是不同的。 |
4樓2011-08-06 02:47:52
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