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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 核酸提取 » 底物結構式的分析
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| 本帖產生 2 個 MolEPI ，點擊這里進行查看 | |||
yanfeier金蟲 (小有名氣)
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[求助]
底物結構式的分析
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這里有沒有人清楚： 如果用同一種酶去催化或者水解某些化學結構式不同的糖苷，這些糖苷的結構不同，會引起不同的水解效率，這不同的水解效率是有不同結構式怎么引起的，有了解的給具體的分析一下吧。 比如β-D-葡萄糖苷和β-D-半乳糖苷，用同一種糖苷酶去水解他們的時候會有不同的水解效率，那這不同的水解效率是這兩種不同的糖苷不同結構怎么起作用引起的。（是空間位阻或者什么，我自己不懂化學，可能問的比較啰嗦或不得當） 期待給為給予指導，謝謝 |
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金幣+5, MolEPI+1): good 2011-08-07 15:44:34
yanfeier(金幣+2): 2011-10-07 20:26:27
yanfeier(金幣+10): 2011-10-27 14:19:01
dhd997(金幣+5, MolEPI+1): good 2011-08-07 15:44:34
yanfeier(金幣+2): 2011-10-07 20:26:27
yanfeier(金幣+10): 2011-10-27 14:19:01
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還是沒人幫你啊~真糾結！ 怎么說呢，這個問題比較復雜的 1，β-D-葡萄糖苷和β-D-半乳糖苷是包含與被包含的意思；也就是說β-D-葡萄糖苷酶可以分為纖維二糖酶：Glcβ（1-4）Glc、龍膽二糖酶：Glcβ（1-6）Glc、半乳糖苷酶Galβ（1-4）Glc等等。有些α葡萄糖苷酶水解還原性末端葡萄糖如水解1，4-α-D-葡萄糖，同時具有水解1，6-α-D-葡萄糖特性；可以水解Glcα（1-4）Glc，也可以水解Galα（1-4）Glc等。 2，酶識別糖苷鍵，主要是通過識別不同的單糖分子、單糖在復合物中的構象：呋喃型和吡喃型，α和β型來實現的，不同單糖分子、吡喃呋喃構型就不多說了，α和β說一下：異頭碳的構型對寡糖分子形狀影響很大，而分子形狀涉及能否被酶識別，例如催化麥芽糖（α糖苷鍵）和纖維二糖（β糖苷鍵）水解需要不同的酶，雖然兩者都是D-葡萄糖通過1-4連接的二聚體。 |
2樓2011-08-06 00:03:34
jinkui960
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【答案】應助回帖
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dhd997(金幣+5, MolEPI+1): good 2011-08-07 15:44:50
yanfeier(金幣+5): 2011-10-07 20:26:34
dhd997(金幣+5, MolEPI+1): good 2011-08-07 15:44:50
yanfeier(金幣+5): 2011-10-07 20:26:34
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根據我們做絲氨酸蛋白酶的經驗，絲氨酸蛋白酶有四個底物結合口袋，這四個底物口袋分別和底物分子的不同原子發(fā)生作用，當同一種蛋白酶催化不同的底物分子的時候，底物分子的原子大小、電荷等性質都決定了它是否能進入酶的底物結合口袋，和底物結合口袋最適合的底物能優(yōu)先和蛋白酶結合，蛋白酶對它的催化效率最高。 所以，針對你的問題： 如果用同一種酶去催化或者水解某些化學結構式不同的糖苷，這些糖苷的結構不同，確實會引起不同的水解效率，不同的水解效率是由不同底物的結構引起的，底物分子的結構決定了它是否能進入酶的底物結合口袋，從而發(fā)生催化反應。 酶的本質是蛋白質，它們的結構是相對穩(wěn)定的，但是酶的結構也有一定的柔性，酶的底物結合口袋也會發(fā)生一定的變化，從而提高催化效率！ |
3樓2011-08-06 00:47:56
gwbk
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【答案】應助回帖
yanfeier(金幣+3): 2011-10-07 20:26:40
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補充一點：關于催化機制 β半乳糖苷酶、溶菌酶屬于誘導契合型催化機制，同時也是廣義的酸堿催化，具體來說： 1，β半乳糖苷酶：在底物乳糖存在下，酶的熒光光譜發(fā)生顯著變化，這種變化是乳糖誘導引起的，酶蛋白的構象改變有利于活性中心與底物的結合和催化反應的進行。 2，溶菌酶：可以容納6個糖殘基，其中第四個糖殘基D環(huán)因為空間的原因，必須由正常的椅式變形為能量較高的半椅式，糖苷鍵穩(wěn)定性降低，鍵由此斷裂。 3，廣義的酸堿催化：這個在水解反應中不難理解，通過H+或OH-以及能提供H+或OH-供體進行催化的反應稱為總酸堿催化，或者廣義酸堿催化。溶菌酶中，提供H+的是Glu。 4，β半乳糖苷酶：以半乳糖衍生物為參照，不同的配基與半乳糖苷酶結合引發(fā)的酶的構象變化和底物形變是不同的，催化效率也是不同的。 |
4樓2011-08-06 02:47:52
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