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[交流]
做一個克隆所需的最短時間?比比誰更高效快速!
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克隆一個基因: 第一天:小體系PCR(上午)-大體系回收(下午)-小樣酶切-大體系酶切回收(包括載體)(晚上)-連接 第二天:早晨轉化-晚上搖菌 第三天:PCR鑒定和提質(zhì)粒酶切鑒定(上午提,下午鑒定) 一切順利的情況下,緊忙乎,有沒有更快更更高效的體系? 求交流! |
分子生化實驗經(jīng)驗積累 |
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專家顧問 (知名作家)
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PCR 用pfu 或者PBO;連接酶用fermentas的T4連接酶,不過buffer我們公司自己配的,后來我試了一下他們公司帶的buffer,也挺好用的; 菌落PCR就是先挑單菌落在200ml的培養(yǎng)基中搖菌1h,然后取2.5ul做PCR(30ul反應體系) 反應體系 體積 H2O 23 μl 10 ×PCR緩沖液 3 μl 正向引物 (50pmol/μl) 0.5 μl 反向引物 (50pmol/μl) 0.5μl DNTP (10mmol/L each) 0.3 μl 菌液 2.5 μl Taq DNA聚合酶 (5U/μl) 0.2 μl 總體系 30 μl |
專家顧問 (職業(yè)作家)
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專家經(jīng)驗: +57 |
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另外IN FUSION,LIC等方法。連酶切連接一步都基本省掉了。更能節(jié)省時間。 看文獻大規(guī)模高通量做構建的時候,均采用上述構建方法。 如果對PCR很有信心,是不是連切膠都可以省掉,直接過一遍PCR純化柱。 另外現(xiàn)在的快速連接,5-10min搞定。、 最后質(zhì)粒也不需要那么復雜,菌落PCR鑒定,甚至快檢跑個電泳證明有插入基因。或者連鑒定都不鑒定(前提載體做得好)直接送測序,反正現(xiàn)在測序也便宜的很。 不過在學校的話,真是沒有必要這么趕,認認真真老老實實,一步一步進行,做好對照,一次成功才是王道 |
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PCR不一定要摸條件,其實連接至需要很少量的DNA分子就夠了,在你跑膠的時候只需要有隱約的條帶就夠了,甚至更少的兩都行。 轉化只需要冰浴15分鐘足夠了,過后的搖菌只是讓感受態(tài)菌恢復。時間長短沒事。柱子直接用DNA膠回收柱就可以了。 從你說的條件也是T載體的要求啊。 如果是亞克隆,可以把回收后的PCR產(chǎn)物直接進行酶切處理,然后再過柱回收。載體片段也可以同樣的方法。因為像幾十bp的小片段,回收柱回收不回來。所以都可以直接用DNA回收柱直接回收。 |




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