 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1562 | 回復(fù): 4 | ||
patent至尊木蟲 (正式寫手)
|
[求助]
怎樣限制鍵角，謝謝
|
|
我的體系是含金屬離子的蛋白酶，如圖，鋅離子與三個(gè)組氨酸的氮螯合，距離為0.22nm左右，角度為96度左右，請(qǐng)問模擬時(shí)怎樣限制鍵角呢，謝謝！��！用gromacs [ Last edited by patent on 2011-8-15 at 18:29 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
【雙一流院校新能源、環(huán)境材料，材料加工與模擬招收大量調(diào)劑】
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
08工學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
材料與化工328分調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
279分求調(diào)劑 一志愿211
已經(jīng)有20人回復(fù)
-
293求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿華東理工大學(xué)081700，初試分?jǐn)?shù)271
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
085404電子信息284分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
306求0703調(diào)劑一志愿華中師范
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
一志愿吉大化學(xué)322求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 求大家?guī)臀铱纯磳徃迦说倪@個(gè)意見（Uiso/Uij？）謝謝大家！��！急
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 在MS的DPD模擬中，如何使粗�；肿泳哂袆傂越Y(jié)構(gòu)？
已經(jīng)有15人回復(fù)
- 【求助】鍵長鍵角等固定后的優(yōu)化..懸賞30...【已經(jīng)解決～感謝～】
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 【求助】單點(diǎn)能計(jì)算
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】結(jié)晶水中H的鍵角怎么限定？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】關(guān)于scan
已經(jīng)有10人回復(fù)
patent
至尊木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 14714.5
- 散金: 20
- 帖子: 459
- 在線: 850.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 57321
- 注冊(cè): 2005-01-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 合成藥物化學(xué)
2樓2011-08-17 12:35:40
patent
至尊木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 14714.5
- 散金: 20
- 帖子: 459
- 在線: 850.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 57321
- 注冊(cè): 2005-01-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 合成藥物化學(xué)
3樓2011-08-18 16:32:43
patent
至尊木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 14714.5
- 散金: 20
- 帖子: 459
- 在線: 850.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 57321
- 注冊(cè): 2005-01-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 合成藥物化學(xué)
|
根據(jù)manual,我用下面的方ro法 [ angle_restraints ] ; i j k l type theta0 fc mult 651 1211 1683 1211 1 96.0 1500 1 但grompp時(shí)報(bào)錯(cuò) WARNING 1 [file test1.top, line 18] Duplicate atom index (1211) in angle_restraints 又改用 [ angle_restraints ] ; i j k l type theta0 fc mult 651 1211 1211 1 96.0 1500 1 但grompp時(shí)報(bào)錯(cuò) Incorrect number of parameters - found 2, expected 3 or 6 for Angle Rest.. 我用gromacs4.5.4版，期待高人解答，萬分感謝�。�！ |
4樓2011-08-20 08:12:19
5樓2011-08-31 10:39:49
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 patent 的主題更新
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料與化工328分調(diào)劑 +4 | 。，。，。，。i 2026-03-23 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 298-一志愿中國農(nóng)業(yè)大學(xué)-求調(diào)劑 +11 | 手機(jī)用戶 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
[考研] 環(huán)境學(xué)碩288求調(diào)劑 +8 | 皮皮皮123456 2026-03-22 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿國科過程所081700，274求調(diào)劑 +3 | 三水研0水立方 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 北科281學(xué)碩材料求調(diào)劑 +8 | tcxiaoxx 2026-03-20 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +12 | 申子申申 2026-03-19 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 324求調(diào)劑 +6 | lucky呀呀呀鴨 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 26研0 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +4 | plum李子 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +10 | Faune 2026-03-21 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 初試 317 +7 | 半拉月丙 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 妮妮ninicgb 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 22 350 本科985求調(diào)劑，求老登收留 +3 | 李軼男003 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 南昌大學(xué)材料專碩311分求調(diào)劑 +6 | 77chaselx 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 初始318分求調(diào)劑（有工作經(jīng)驗(yàn)） +3 | 1911236844 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 曼殊2266 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)碩297已過四六級(jí)求調(diào)劑推薦 +11 | adaie 2026-03-19 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 353求調(diào)劑 +3 | 拉鉤不許變 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 申博26年 +3 | 八6八68 2026-03-19 | 3/150 |
|