 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 23 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 4368 | 回復(fù): 22 | |||||
[交流]
【求助】鍵長鍵角等固定后的優(yōu)化..懸賞30...【已經(jīng)解決～感謝～】
|
|||||
|
新手問題........... 現(xiàn)在正在找一個(gè)過渡態(tài)，沒有固定鍵長鍵角之前，構(gòu)型偏離較大最后就不能收斂，或者分子散了，若構(gòu)型偏離較小就會(huì)優(yōu)化直接到穩(wěn)定態(tài) 現(xiàn)在準(zhǔn)備固定某個(gè)鍵長后繼續(xù)優(yōu)化，用gaussview建立模型之后，用自帶的redundant，然后手動(dòng)再修改某幾個(gè)數(shù)值，輸入文件中有： D 4 1 2 3 -120.000000 F 這樣的描述，計(jì)算過程中也沒有出錯(cuò)，但是最后鍵角仍舊偏離較大，鍵長也是如此 想請(qǐng)教一下這個(gè)如果固定鍵長之后優(yōu)化，gaussian是在這個(gè)輸入結(jié)構(gòu)附近尋找收斂點(diǎn)么？若在這個(gè)點(diǎn)附近找不到最小點(diǎn)是不是就會(huì)破壞這個(gè)限制？加上了鍵長鍵角限制之后和沒有加鍵長鍵角有什么區(qū)別呢？ 或者....悲情的就是固定方法不對(duì)，輸入文件不對(duì)？ 求大神詳解...或者能麻煩提供詳解的鏈接地址么？.... [ Last edited by 亍寞 on 2011-3-12 at 21:17 ] |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 量化計(jì)算有意義的討論 | Gaussian |
» 猜你喜歡
溫州大學(xué)新能源材料微觀溯源課題組招收2026級(jí)博士研究生（材料、化學(xué)方向）
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料與化工 323 英一+數(shù)二+物化，一志愿：哈工大 本人本科雙一流
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有256人回復(fù)
-
26申博
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
巴黎西岱大學(xué)（Université Paris Cité）Fayna MAMMERI 導(dǎo)師尋找CSC公派博士生
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
中國散裂中子源誠聘“AI材料計(jì)算”方向博士后/職工
已經(jīng)有87人回復(fù)
-
能源環(huán)境新材料研究團(tuán)隊(duì) 導(dǎo)師介紹 研究生招生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
能源環(huán)境新材料研究團(tuán)隊(duì) 導(dǎo)師介紹 研究生招生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
能源環(huán)境新材料研究團(tuán)隊(duì) 導(dǎo)師介紹 研究生招生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
348 求調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
招收 材料、新能源、冶金、化工、環(huán)境 等工科類考生
已經(jīng)有2人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 如何固定鍵長進(jìn)行優(yōu)化
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 求助關(guān)于水分子優(yōu)化后的鍵長鍵角
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 計(jì)算晶體怎樣減少鍵長鍵角的相對(duì)誤差？怎樣確定中心原子周圍鍵的鍵組成？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- Gaussian幾何優(yōu)化后的鍵長不合理
已經(jīng)有41人回復(fù)
- 計(jì)算分子的鍵長，鍵角，鍵能
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 鍵長與鍵角表
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】怎么從結(jié)果中提取徑向分布函數(shù)、鍵長、鍵角
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 【求助】加了虛原子要怎么固定鍵長優(yōu)化
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】大俠們，求葉綠素a的詳細(xì)的鍵長鍵角~~
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】優(yōu)化結(jié)果中有多組鍵長數(shù)據(jù)（ Distance matrix (angstroms)），我該用哪一組
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【討論】【求助】固定鍵長優(yōu)化，成功收斂；不固定鍵長放開全優(yōu)化不收斂？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教：xp中用environment指令得到的鍵長鍵角數(shù)據(jù)如何看？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】關(guān)于生成鍵長鍵角問題的求助
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】discover 里面怎么分析氫鍵的鍵角和鍵長分布
已經(jīng)有12人回復(fù)
» 搶金幣啦！回帖就可以得到:
-
【強(qiáng)推｜可留�！繚�(jì)南大學(xué)博士后招聘（水利工程/鐵錳碳環(huán)境過程）
+1/297
-
94年女征男友
+1/270
-
南方醫(yī)科大學(xué)中藥學(xué)院 調(diào)劑碩士生一名 中藥學(xué)專業(yè)
+1/84
-
電力全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室雙一流A類長江學(xué)者團(tuán)隊(duì)招2026年全日制博士1名（4月3日截止）
+2/78
-
[b]【材料表征】成分含量丨微觀形貌丨分子結(jié)構(gòu)丨材料加工丨預(yù)存服務(wù)[/b]
+1/76
-
浙江省人民醫(yī)院博士后崗位招聘
+1/46
-
福建師范大學(xué)環(huán)境與資源學(xué)院環(huán)境電化學(xué)課題組招收2026碩士（含調(diào)劑）
+1/31
-
雙一流大學(xué)湘潭大學(xué)“化工過程模擬與強(qiáng)化”國家地方聯(lián)合工程研究中心招收各類博士生
+1/16
-
Alicat 層流壓差質(zhì)量流量控制器在新型硅碳負(fù)極流化床的應(yīng)用- 艾里卡特（Alicat）
+3/13
-
廣東唯一石化院�！Y源與環(huán)境專碩招生
+1/13
-
2026年材料/冶金/化工碩士調(diào)劑-上海大學(xué)全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室-激光冶金與硅基材料制備
+1/11
-
誠摯招生（碩士+博士）
+1/9
-
武漢紡織大學(xué)招收碩士研究生調(diào)劑 （社牛最好）
+1/8
-
南開大學(xué)陳樹琪教授研究團(tuán)隊(duì)招收2026級(jí)超構(gòu)材料方向博士研究生
+1/7
-
南京林業(yè)大學(xué)化學(xué)工程學(xué)院柏惺峰課題組誠聘科研助理、水杉英才E類/F類青年教師或博后
+1/7
-
中國科學(xué)院大學(xué)納米科學(xué)與技術(shù)學(xué)院-羅聃課題組誠招碩士研究生
+1/7
-
Top-88悉尼科技大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)/AI 招收2027年入學(xué) 校獎(jiǎng) 博士生1到2名(國際和本地學(xué)生）
+1/6
-
機(jī)械求調(diào)劑 讀研還想學(xué)機(jī)械
+1/5
-
湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 環(huán)境科學(xué)與工程0830+資源與環(huán)境專碩0857 調(diào)劑名額
+1/5
-
中國人民大學(xué)物理學(xué)系蔡鵬課題組招收優(yōu)秀碩士博士研究生
+1/1
2樓2011-03-12 14:31:06
|
謝謝，現(xiàn)在您所說的主要的反應(yīng)坐標(biāo)已經(jīng)找到了，是鍵長，但是就是再固定的時(shí)候除了點(diǎn)問題，固定之后計(jì)算，但是計(jì)算結(jié)果中這個(gè)希望固定的鍵長你卻恢復(fù)了穩(wěn)定態(tài)的鍵長，因?yàn)橐郧皼]有固定過鍵長進(jìn)行計(jì)算，所以也不知道是不是固定方法有問題 這是部分輸入文件：（z-matrix） %mem=3500MB %nprocshared=2 #p opt=(modredundant,maxcyc=200) freq b3lyp/genecp scf=tight 鍵說明部分。。。略 B1 4.900000 基組說明部分。。。略 請(qǐng)問這個(gè)是一定要用popt命令么？那么popt（參數(shù)）中的參數(shù)又應(yīng)該怎么設(shè)置比較好？您所說的反應(yīng)坐標(biāo)的逐漸改變是用scan命令還是人為的固定不同鍵長? 十分感謝您的回復(fù)！ |
3樓2011-03-12 15:04:00
4樓2011-03-12 16:55:50
5樓2011-03-12 17:22:28
6樓2011-03-12 18:42:32
7樓2011-03-12 19:06:50
8樓2011-03-12 19:23:36
|
謝謝回復(fù)，這個(gè)原理我明白，是輸入文件的問題，麻煩您看下，這是我剛才用乙烷分子做了嘗試，想固定兩個(gè)碳原子之間的距離之后優(yōu)化，這是輸入文件 %mem=3200MB %nprocshared=2 #p opt(modredundant) freq b3lyp/6-31g scf=tight Title Card Required 0 1 C H 1 B1 H 1 B2 2 A1 H 1 B3 2 A2 3 D1 C 1 B4 2 A3 3 D2 H 5 B5 1 A4 2 D3 H 5 B6 1 A5 2 D4 H 5 B7 1 A6 2 D5 B1 1.07000000 B2 1.07000000 B3 1.07000000 B4 2.00000000 B5 1.07000000 B6 1.07000000 B7 1.07000000 A1 109.47120255 A2 109.47123134 A3 109.47120255 A4 109.47120255 A5 109.47120255 A6 109.47123134 D1 119.99999260 D2 -120.00001480 D3 179.88890000 D4 -60.11108520 D5 59.88890740 constant: B 4 5 2.00000000 （4 5 原子就是兩個(gè)碳原子） 計(jì)算過程中沒有出錯(cuò)，但是在最后看輸出文件的時(shí)候發(fā)現(xiàn)鍵長又回去了，不知道應(yīng)該怎么輸入，像上面那個(gè)輸入文件，應(yīng)該怎么改可以改對(duì)呢？ |
9樓2011-03-12 19:32:20
11樓2011-03-12 19:55:18
|
乙烷你可以試試這個(gè)： #p opt(modredundant) b3lyp/6-31g scf=tight Title Card Required 0 1 C 0.000000 0.000000 0.000000 C 0.000000 0.000000 1.450000 H 1.026719 0.000000 1.813000 H -0.513360 0.889165 1.813000 H -0.513360 -0.889165 1.813000 H -1.026719 0.000000 -0.363000 H 0.513360 0.889165 -0.363000 H 0.513360 -0.889165 -0.363000 B 1 2 2.0 F 空行 |
12樓2011-03-12 20:05:17
13樓2011-03-12 20:41:41
14樓2011-03-12 21:09:27
15樓2011-03-12 21:15:30
16樓2011-03-12 22:13:37
17樓2011-03-12 23:33:54
18樓2011-03-13 08:15:28
19樓2012-03-05 11:23:28
20樓2012-03-30 11:51:03
23樓2012-03-30 18:55:27
簡單回復(fù)
angelkiss10樓
2011-03-12 19:38
回復(fù)
亍寞(金幣+1):謝謝參與
zq52252621樓
2012-03-30 17:49
回復(fù)
亍寞(金幣+1): 謝謝參與
2012-03-30 17:51
回復(fù)
亍寞(金幣+1): 謝謝參與
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 亍寞 的主題更新
| 23 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 291 求調(diào)劑 +7 | 化工2026屆畢業(yè)?/a> 2026-03-21 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿上海交大生物與醫(yī)藥專碩324分，求調(diào)劑 +6 | jiajunX 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
|
[考研]
 085602 289分求調(diào)劑
+7
|
WWW西西弗斯 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
[考研] 材料學(xué)碩333求調(diào)劑 +4 | 北道巷 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料與化工303分求調(diào)劑 +4 | 為學(xué)666 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +7 | shxchem 2026-03-20 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 085601求調(diào)劑總分293英一數(shù)二 +3 | 鋼鐵大炮 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | 林之夕 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 080500求調(diào)劑 +3 | zzzzfan 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +3 | desto 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué) 070300 學(xué)碩 336分 求調(diào)劑 +7 | vv迷 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +5 | 孅華 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315分，誠求調(diào)劑，材料與化工085600 +3 | 13756423260 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿中南化學(xué)（0703）總分337求調(diào)劑 +9 | niko- 2026-03-19 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 260求調(diào)劑 +3 | 朱芷琳 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境總分308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 279求調(diào)劑 +5 | 紅衣隱官 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 22 350 本科985求調(diào)劑，求老登收留 +3 | 李軼男003 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 白QF 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | @taotao 2026-03-20 | 3/150 |
|