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[交流]
【求助】鍵長鍵角等固定后的優(yōu)化..懸賞30...【已經(jīng)解決～感謝～】
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新手問題........... 現(xiàn)在正在找一個過渡態(tài)，沒有固定鍵長鍵角之前，構型偏離較大最后就不能收斂，或者分子散了，若構型偏離較小就會優(yōu)化直接到穩(wěn)定態(tài) 現(xiàn)在準備固定某個鍵長后繼續(xù)優(yōu)化，用gaussview建立模型之后，用自帶的redundant，然后手動再修改某幾個數(shù)值，輸入文件中有： D 4 1 2 3 -120.000000 F 這樣的描述，計算過程中也沒有出錯，但是最后鍵角仍舊偏離較大，鍵長也是如此 想請教一下這個如果固定鍵長之后優(yōu)化，gaussian是在這個輸入結構附近尋找收斂點么？若在這個點附近找不到最小點是不是就會破壞這個限制？加上了鍵長鍵角限制之后和沒有加鍵長鍵角有什么區(qū)別呢？ 或者....悲情的就是固定方法不對，輸入文件不對？ 求大神詳解...或者能麻煩提供詳解的鏈接地址么？.... [ Last edited by 亍寞 on 2011-3-12 at 21:17 ] |
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 量化計算有意義的討論 | Gaussian |
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2樓2011-03-12 14:31:06
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謝謝，現(xiàn)在您所說的主要的反應坐標已經(jīng)找到了，是鍵長，但是就是再固定的時候除了點問題，固定之后計算，但是計算結果中這個希望固定的鍵長你卻恢復了穩(wěn)定態(tài)的鍵長，因為以前沒有固定過鍵長進行計算，所以也不知道是不是固定方法有問題 這是部分輸入文件：（z-matrix） %mem=3500MB %nprocshared=2 #p opt=(modredundant,maxcyc=200) freq b3lyp/genecp scf=tight 鍵說明部分。。。略 B1 4.900000 基組說明部分。。。略 請問這個是一定要用popt命令么？那么popt（參數(shù)）中的參數(shù)又應該怎么設置比較好？您所說的反應坐標的逐漸改變是用scan命令還是人為的固定不同鍵長? 十分感謝您的回復！ |
3樓2011-03-12 15:04:00
4樓2011-03-12 16:55:50
5樓2011-03-12 17:22:28
6樓2011-03-12 18:42:32
7樓2011-03-12 19:06:50
8樓2011-03-12 19:23:36
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謝謝回復，這個原理我明白，是輸入文件的問題，麻煩您看下，這是我剛才用乙烷分子做了嘗試，想固定兩個碳原子之間的距離之后優(yōu)化，這是輸入文件 %mem=3200MB %nprocshared=2 #p opt(modredundant) freq b3lyp/6-31g scf=tight Title Card Required 0 1 C H 1 B1 H 1 B2 2 A1 H 1 B3 2 A2 3 D1 C 1 B4 2 A3 3 D2 H 5 B5 1 A4 2 D3 H 5 B6 1 A5 2 D4 H 5 B7 1 A6 2 D5 B1 1.07000000 B2 1.07000000 B3 1.07000000 B4 2.00000000 B5 1.07000000 B6 1.07000000 B7 1.07000000 A1 109.47120255 A2 109.47123134 A3 109.47120255 A4 109.47120255 A5 109.47120255 A6 109.47123134 D1 119.99999260 D2 -120.00001480 D3 179.88890000 D4 -60.11108520 D5 59.88890740 constant: B 4 5 2.00000000 （4 5 原子就是兩個碳原子） 計算過程中沒有出錯，但是在最后看輸出文件的時候發(fā)現(xiàn)鍵長又回去了，不知道應該怎么輸入，像上面那個輸入文件，應該怎么改可以改對呢？ |
9樓2011-03-12 19:32:20
11樓2011-03-12 19:55:18
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乙烷你可以試試這個： #p opt(modredundant) b3lyp/6-31g scf=tight Title Card Required 0 1 C 0.000000 0.000000 0.000000 C 0.000000 0.000000 1.450000 H 1.026719 0.000000 1.813000 H -0.513360 0.889165 1.813000 H -0.513360 -0.889165 1.813000 H -1.026719 0.000000 -0.363000 H 0.513360 0.889165 -0.363000 H 0.513360 -0.889165 -0.363000 B 1 2 2.0 F 空行 |
12樓2011-03-12 20:05:17
13樓2011-03-12 20:41:41
14樓2011-03-12 21:09:27
15樓2011-03-12 21:15:30
16樓2011-03-12 22:13:37
17樓2011-03-12 23:33:54
18樓2011-03-13 08:15:28
19樓2012-03-05 11:23:28
20樓2012-03-30 11:51:03
23樓2012-03-30 18:55:27
簡單回復
angelkiss10樓
2011-03-12 19:38
回復
亍寞(金幣+1):謝謝參與
zq52252621樓
2012-03-30 17:49
回復
亍寞(金幣+1): 謝謝參與
藍色調調22樓
2012-03-30 17:51
回復
亍寞(金幣+1): 謝謝參與
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