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亍寞

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[交流] 【求助】鍵長鍵角等固定后的優(yōu)化..懸賞30...【已經(jīng)解決～感謝～】

新手問題...........
現(xiàn)在正在找一個過渡態(tài)，沒有固定鍵長鍵角之前，構(gòu)型偏離較大最后就不能收斂，或者分子散了，若構(gòu)型偏離較小就會優(yōu)化直接到穩(wěn)定態(tài)
現(xiàn)在準(zhǔn)備固定某個鍵長后繼續(xù)優(yōu)化，用gaussview建立模型之后，用自帶的redundant，然后手動再修改某幾個數(shù)值，輸入文件中有：
D 4 1 2 3 -120.000000 F
這樣的描述，計算過程中也沒有出錯，但是最后鍵角仍舊偏離較大，鍵長也是如此

想請教一下這個如果固定鍵長之后優(yōu)化，gaussian是在這個輸入結(jié)構(gòu)附近尋找收斂點(diǎn)么？若在這個點(diǎn)附近找不到最小點(diǎn)是不是就會破壞這個限制？加上了鍵長鍵角限制之后和沒有加鍵長鍵角有什么區(qū)別呢？

或者....悲情的就是固定方法不對，輸入文件不對？

求大神詳解...或者能麻煩提供詳解的鏈接地址么？....

[ Last edited by 亍寞 on 2011-3-12 at 21:17 ]

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1樓 2011-03-11 14:48:28

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qlihytc

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不是SCAN，這樣，給你篇文獻(xiàn)看看吧
羥基負(fù)離子與一氟甲烷雙分子親核取代反應(yīng)的量子化學(xué)研究

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4樓2011-03-12 16:55:50

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qlihytc

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亍寞(金幣+10): 謝謝回復(fù)，還有些許問題還請您不吝賜教！ 2011-03-12 15:04:29

我建議這樣尋找：
找到一個主要的反應(yīng)坐標(biāo)，鍵長或者鍵角，固定這個反應(yīng)坐標(biāo)，然后popt，通過反應(yīng)坐標(biāo)的逐漸改變，得到一條反應(yīng)的PES，再在最高點(diǎn)進(jìn)行激發(fā)態(tài)優(yōu)化

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2樓2011-03-12 14:31:06

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引用回帖:

Originally posted by qlihytc at 2011-03-12 14:31:06:
我建議這樣尋找：
找到一個主要的反應(yīng)坐標(biāo)，鍵長或者鍵角，固定這個反應(yīng)坐標(biāo)，然后popt，通過反應(yīng)坐標(biāo)的逐漸改變，得到一條反應(yīng)的PES，再在最高點(diǎn)進(jìn)行激發(fā)態(tài)優(yōu)化

謝謝，現(xiàn)在您所說的主要的反應(yīng)坐標(biāo)已經(jīng)找到了，是鍵長，但是就是再固定的時候除了點(diǎn)問題，固定之后計算，但是計算結(jié)果中這個希望固定的鍵長你卻恢復(fù)了穩(wěn)定態(tài)的鍵長，因為以前沒有固定過鍵長進(jìn)行計算，所以也不知道是不是固定方法有問題
這是部分輸入文件：（z-matrix）
%mem=3500MB

%nprocshared=2

#p opt=(modredundant,maxcyc=200) freq b3lyp/genecp scf=tight
鍵說明部分。。。略
B1 4.900000

基組說明部分。。。略

請問這個是一定要用popt命令么？那么popt（參數(shù)）中的參數(shù)又應(yīng)該怎么設(shè)置比較好？您所說的反應(yīng)坐標(biāo)的逐漸改變是用scan命令還是人為的固定不同鍵長?

十分感謝您的回復(fù)！

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3樓2011-03-12 15:04:00

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引用回帖:

Originally posted by qlihytc at 2011-03-12 16:55:50:
不是SCAN，這樣，給你篇文獻(xiàn)看看吧
羥基負(fù)離子與一氟甲烷雙分子親核取代反應(yīng)的量子化學(xué)研究

謝謝你，理論部分已經(jīng)是有一定了解的，主要問題就在如何輸入上面，我之前沒有用過popt這個命令，不知道相關(guān)參數(shù)應(yīng)該怎么改？
這個輸入無論用哪一鐘坐標(biāo)形式都沒有辦法解決，在郭勇和官方指南，還有自帶的text中都沒有找到相關(guān)說明，您有沒有類似的資料呢？

不勝感激

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5樓2011-03-12 17:22:28

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