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亍寞

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[交流] 【求助】鍵長(zhǎng)鍵角等固定后的優(yōu)化..懸賞30...【已經(jīng)解決～感謝～】

新手問(wèn)題...........
現(xiàn)在正在找一個(gè)過(guò)渡態(tài)，沒(méi)有固定鍵長(zhǎng)鍵角之前，構(gòu)型偏離較大最后就不能收斂，或者分子散了，若構(gòu)型偏離較小就會(huì)優(yōu)化直接到穩(wěn)定態(tài)
現(xiàn)在準(zhǔn)備固定某個(gè)鍵長(zhǎng)后繼續(xù)優(yōu)化，用gaussview建立模型之后，用自帶的redundant，然后手動(dòng)再修改某幾個(gè)數(shù)值，輸入文件中有：
D 4 1 2 3 -120.000000 F
這樣的描述，計(jì)算過(guò)程中也沒(méi)有出錯(cuò)，但是最后鍵角仍舊偏離較大，鍵長(zhǎng)也是如此

想請(qǐng)教一下這個(gè)如果固定鍵長(zhǎng)之后優(yōu)化，gaussian是在這個(gè)輸入結(jié)構(gòu)附近尋找收斂點(diǎn)么？若在這個(gè)點(diǎn)附近找不到最小點(diǎn)是不是就會(huì)破壞這個(gè)限制？加上了鍵長(zhǎng)鍵角限制之后和沒(méi)有加鍵長(zhǎng)鍵角有什么區(qū)別呢？

或者....悲情的就是固定方法不對(duì)，輸入文件不對(duì)？

求大神詳解...或者能麻煩提供詳解的鏈接地址么？....

[ Last edited by 亍寞 on 2011-3-12 at 21:17 ]

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1樓 2011-03-11 14:48:28

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引用回帖:

Originally posted by qlihytc at 2011-03-12 18:42:32:
我的意思是部分優(yōu)化（因?yàn)槟愎潭艘粋€(gè)坐標(biāo)了），關(guān)鍵詞就是opt，或者popt都可以

不好意思，還請(qǐng)您明示.........
我現(xiàn)在輸入文件中命令就是opt，還需要做下freq，是希望部分優(yōu)化，但是gaussian優(yōu)化結(jié)果就是全優(yōu)化的結(jié)果，這個(gè)部分優(yōu)化的設(shè)置并沒(méi)有體現(xiàn)出來(lái)啊？

體現(xiàn)在輸入文件上，我的輸入問(wèn)題在哪里呢？應(yīng)該怎么改？

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回復(fù)此樓

7樓2011-03-12 19:06:50

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亍寞(金幣+10): 謝謝回復(fù)，還有些許問(wèn)題還請(qǐng)您不吝賜教！ 2011-03-12 15:04:29

我建議這樣尋找：
找到一個(gè)主要的反應(yīng)坐標(biāo)，鍵長(zhǎng)或者鍵角，固定這個(gè)反應(yīng)坐標(biāo)，然后popt，通過(guò)反應(yīng)坐標(biāo)的逐漸改變，得到一條反應(yīng)的PES，再在最高點(diǎn)進(jìn)行激發(fā)態(tài)優(yōu)化

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2樓2011-03-12 14:31:06

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引用回帖:

Originally posted by qlihytc at 2011-03-12 14:31:06:
我建議這樣尋找：
找到一個(gè)主要的反應(yīng)坐標(biāo)，鍵長(zhǎng)或者鍵角，固定這個(gè)反應(yīng)坐標(biāo)，然后popt，通過(guò)反應(yīng)坐標(biāo)的逐漸改變，得到一條反應(yīng)的PES，再在最高點(diǎn)進(jìn)行激發(fā)態(tài)優(yōu)化

謝謝，現(xiàn)在您所說(shuō)的主要的反應(yīng)坐標(biāo)已經(jīng)找到了，是鍵長(zhǎng)，但是就是再固定的時(shí)候除了點(diǎn)問(wèn)題，固定之后計(jì)算，但是計(jì)算結(jié)果中這個(gè)希望固定的鍵長(zhǎng)你卻恢復(fù)了穩(wěn)定態(tài)的鍵長(zhǎng)，因?yàn)橐郧皼](méi)有固定過(guò)鍵長(zhǎng)進(jìn)行計(jì)算，所以也不知道是不是固定方法有問(wèn)題
這是部分輸入文件：（z-matrix）
%mem=3500MB

%nprocshared=2

#p opt=(modredundant,maxcyc=200) freq b3lyp/genecp scf=tight
鍵說(shuō)明部分。。。略
B1 4.900000

基組說(shuō)明部分。。。略

請(qǐng)問(wèn)這個(gè)是一定要用popt命令么？那么popt（參數(shù)）中的參數(shù)又應(yīng)該怎么設(shè)置比較好？您所說(shuō)的反應(yīng)坐標(biāo)的逐漸改變是用scan命令還是人為的固定不同鍵長(zhǎng)?

十分感謝您的回復(fù)！

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3樓2011-03-12 15:04:00

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qlihytc

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不是SCAN，這樣，給你篇文獻(xiàn)看看吧
羥基負(fù)離子與一氟甲烷雙分子親核取代反應(yīng)的量子化學(xué)研究

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4樓2011-03-12 16:55:50

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