 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 2163 | 回復: 16 | ||
adslye銀蟲 (正式寫手)
|
[求助]
文章被人搶先發(fā)了！想用信息學分析改變文章方向。問：信息學分析相關。
|
 背景：辛苦做的東西，被洋人先發(fā)了�。。。。。。”瘎~~~~~~~ 有一部分數(shù)據(jù)是一定數(shù)量的基因表達量real-time pcr數(shù)據(jù)和LC-MS數(shù)據(jù)。測了一個代謝通路中大部分基因，大約20個基因在兩種條件，9個連續(xù)時間點的表達量（20*2*9=360個數(shù)據(jù)），以及在這些時間點每個基因?qū)饔玫幕衔锏暮?360）。這是一個有價值的代謝通路，但很多基因功能研究不深。 本人藥學出生，研究生轉(zhuǎn)生物，對于生物信息學，實在是殺不動了 目的：能否通過生物信息學手段從這些數(shù)據(jù)中挖出點東西，做一篇實驗與信息學結(jié)合的文章。 想問： 1.這種樣本量做聚類分析有意義嗎？想把一些各時間點表達趨勢相似的基因和化合物聚類。這樣可能說明它們受同一些因素調(diào)控。 2.同樣關聯(lián)分析可做嗎？因為很多基因的功能沒被研究，但有幾個潛在的轉(zhuǎn)錄因子被報道�？梢愿鶕�(jù)轉(zhuǎn)錄因子和可能目的基因的表達趨勢做關聯(lián)分析嗎？（就是說很可能這個轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控這些基因） 3.如果1或2可行，有哪些軟件可以做。 4.有沒有其他的信息學手段分析下以上那些數(shù)據(jù)？因為很可能我病急亂投醫(yī)想的點子其 實不可行。 5.這樣的文章應該發(fā)什么樣的雜志，因為結(jié)合了生物，化學，信息學，但都不深入。有過來人嗎？ 自己已有思路（重復的想法就不用回復了，多謝）： 1.通過化合物的含量以及基因的表達量，基本可以確定哪些地方是調(diào)控的節(jié)點。 2.兩種誘導條件誘導機制上的差異與關系。調(diào)控哪些基因和化合物這個也可以知道。 這次有力的回答的獎勵都>10!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!獎池不時補充！�。。�！ 感謝各位了！�。。。。。。。。。。。。。。。。。�！ [ Last edited by adslye on 2011-8-27 at 15:27 ] |
回復此樓» 猜你喜歡
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有8人回復
-
環(huán)境領域全國重點實驗室招收博士1-2名
已經(jīng)有3人回復
-
材料專碩306英一數(shù)二
已經(jīng)有10人回復
-
301求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復
-
一志愿天津大學化學工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復
-
26博士申請
已經(jīng)有3人回復
-
268求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復
-
被我言中：新模板不強調(diào)格式了，假專家開始管格式了
已經(jīng)有4人回復
» 本主題相關價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 計算機方向研究形式化方法是不是比較難出sci文章��？
已經(jīng)有29人回復
- 分析化學中的動力學研究內(nèi)容是哪些？審稿人要求用理論來提高文章檔次，如何回答呀?
已經(jīng)有9人回復
- 自己改進了一個模型，從不同角度分析數(shù)據(jù)，寫了兩篇文章，是否算雷同
已經(jīng)有15人回復
- 【分享】袁隆平院士兩優(yōu)培九超級雜交水稻轉(zhuǎn)錄組分析文章，發(fā)表在PNAS上
已經(jīng)有59人回復
- 【討論】有做人臉識別，舌相醫(yī)學診斷的嗎，導師今天傳給我一篇文章，說這個方向很新
已經(jīng)有16人回復
- 【求助/交流】生物信息學的文章
已經(jīng)有5人回復
- 【求助】中藥分析文章投稿問題，求雜志社推薦
已經(jīng)有22人回復
- 《光譜學與光譜分析》接收英文文章嗎？
已經(jīng)有4人回復
- 【分享】神經(jīng)計算、機器學習最好會議之一的nips歷年（1987-2008）文章免費下載
已經(jīng)有50人回復
adslye
銀蟲 (正式寫手)
- BioEPI: 10
- 應助: 6 (幼兒園)
- 貴賓: 0.244
- 金幣: 364.9
- 散金: 766
- 紅花: 6
- 帖子: 514
- 在線: 119.5小時
- 蟲號: 845336
- 注冊: 2009-09-11
- 性別: GG
- 專業(yè): 流行病學方法與衛(wèi)生統(tǒng)計
2樓2011-08-26 17:07:51
cexoihtydx
金蟲 (正式寫手)
- BioEPI: 12
- 應助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 581.3
- 散金: 906
- 紅花: 5
- 帖子: 766
- 在線: 263.3小時
- 蟲號: 722752
- 注冊: 2009-03-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 人類遺傳學
3樓2011-08-26 19:09:25
amisking
榮譽版主 (文壇精英)
- 應助: 45 (小學生)
- 貴賓: 28.304
- 金幣: 51353.9
- 散金: 3080
- 紅花: 78
- 沙發(fā): 17
- 帖子: 13022
- 在線: 839小時
- 蟲號: 514230
- 注冊: 2008-02-28
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物資源與分類學
- 管轄: 分子生物
4樓2011-08-26 19:59:40
adslye
銀蟲 (正式寫手)
- BioEPI: 10
- 應助: 6 (幼兒園)
- 貴賓: 0.244
- 金幣: 364.9
- 散金: 766
- 紅花: 6
- 帖子: 514
- 在線: 119.5小時
- 蟲號: 845336
- 注冊: 2009-09-11
- 性別: GG
- 專業(yè): 流行病學方法與衛(wèi)生統(tǒng)計
5樓2011-08-27 07:54:43
wanhscn
木蟲 (職業(yè)作家)
哲學@草根
- 應助: 53 (初中生)
- 貴賓: 0.87
- 金幣: 3895.7
- 散金: 877
- 紅花: 27
- 沙發(fā): 14
- 帖子: 3642
- 在線: 526.2小時
- 蟲號: 1376762
- 注冊: 2011-08-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 植物遺傳學
【答案】應助回帖
★ ★ ★
lstt09nk(金幣+3): 感謝交流， 2011-08-27 10:36:33
adslye(金幣+15): 感謝！思路我懂了。聚類用什么軟件做呢？ 2011-08-27 12:21:17
adslye(金幣+20): 后面那兩貼不是應助，不能給金幣。非常感謝！ 2011-08-27 15:25:14
lstt09nk(金幣+3): 感謝交流， 2011-08-27 10:36:33
adslye(金幣+15): 感謝！思路我懂了。聚類用什么軟件做呢？ 2011-08-27 12:21:17
adslye(金幣+20): 后面那兩貼不是應助，不能給金幣。非常感謝！ 2011-08-27 15:25:14
|
做關聯(lián)分析要有群體以及相關群體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)（軟件Tassel， Structure ），如果沒有的話，那還不如做轉(zhuǎn)基因研究功能。 聚類是要做，聚類可以對功能的分析提供參考，不過需要多個植物物種包括水稻擬南介的基因序列，這樣根據(jù)水稻擬南芥的功能情況以及聚類的結(jié)果分析你的物種。 |
6樓2011-08-27 09:17:04
wanhscn
木蟲 (職業(yè)作家)
哲學@草根
- 應助: 53 (初中生)
- 貴賓: 0.87
- 金幣: 3895.7
- 散金: 877
- 紅花: 27
- 沙發(fā): 14
- 帖子: 3642
- 在線: 526.2小時
- 蟲號: 1376762
- 注冊: 2011-08-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 植物遺傳學
7樓2011-08-27 15:05:59
wanhscn
木蟲 (職業(yè)作家)
哲學@草根
- 應助: 53 (初中生)
- 貴賓: 0.87
- 金幣: 3895.7
- 散金: 877
- 紅花: 27
- 沙發(fā): 14
- 帖子: 3642
- 在線: 526.2小時
- 蟲號: 1376762
- 注冊: 2011-08-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 植物遺傳學
8樓2011-08-27 15:07:19
jsh0610
鐵桿木蟲 (正式寫手)
- 應助: 10 (幼兒園)
- 金幣: 9642.9
- 紅花: 4
- 帖子: 972
- 在線: 115.5小時
- 蟲號: 290845
- 注冊: 2006-10-28
- 性別: MM
- 專業(yè): 生物力學
9樓2011-08-28 22:46:09
scelab
榮譽版主 (文壇精英)
小木蟲之有關部門負責人
- 應助: 63 (初中生)
- 貴賓: 1.475
- 金幣: 8294.6
- 散金: 4158
- 紅花: 39
- 沙發(fā): 99
- 帖子: 21277
- 在線: 3169.3小時
- 蟲號: 482065
- 注冊: 2007-12-20
- 性別: GG
- 專業(yè): 環(huán)境微生物學
- 管轄: 微生物
10樓2011-08-28 22:54:59
相關版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 adslye 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +9 | 冬十三 2026-03-15 | 10/500 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑 ，六級已過，有科研經(jīng)歷 +8 | 曦熙兮 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料，紡織，生物（0856、0710），化學招生啦 +3 | Eember. 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料工程專碩調(diào)劑 +5 | 204818@lcx 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料專碩274一志愿陜西師范大學求調(diào)劑 +5 | 薛云鵬 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 淇ya_~ 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑，求各位老師收留 +8 | 秋有木北 2026-03-14 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范071000，325求調(diào)劑 +6 | RuitingC 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 070303 總分349求調(diào)劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑 +3 | Zys010410@ 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 本科南京大學一志愿川大藥學327 +3 | 麥田耕者 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 331求調(diào)劑（0703有機化學 +5 | ZY-05 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +6 | 邱gl 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿中科院，化學方向，295求調(diào)劑 +4 | 一氧二氮 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料與化工求調(diào)劑一志愿 985 總分 295 +8 | dream…… 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +7 | 7712b 2026-03-13 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +3 | 小匕仔汁 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑（食品/專碩） +3 | xc321 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考博] 2026年博士申請 +3 | QwQwQW10 2026-03-11 | 3/150 |
|