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kekexiliwolf金蟲 (正式寫手)
小屁蟲
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[求助]
旋光值計算結(jié)果分析
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本人在波長589nm下計算旋光，但是結(jié)果和實驗值有點差距，可能是計算值和實驗值的單位和濃度不一樣，我想問問計算值給出的結(jié)果是比旋光度嗎？如何得來的， w= 0.000000 a.u., Optical Rotation Beta= -0.2141 au. Molar Mass = 308.3304 grams/mole, [Alpha]D = -26.84 deg. G' tensor for W= 0.077357: 7.37664212-15.65843256 -9.02937206 26.58281053 -6.75150182 -7.26231548 0.61589955 1.31519761 0.17403044 w= 0.077357 a.u., Optical Rotation Beta= -0.2664 au. Molar Mass = 308.3304 grams/mole, [Alpha] ( 5890.0 A) = -33.43 deg. G*W tensor for W= 0.077357: 實驗值是-13 |
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3樓2013-12-03 23:26:04
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【答案】應(yīng)助回帖
kekexiliwolf(金幣+3): 非常感謝，受益匪淺 2011-08-29 08:09:40
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可見計算得到的是-33那個，589nm。這差別不算大，最主要的是符號要相同。因為在實驗中一是溶劑，二是溫度等等條件，而計算是在氣相�？隙〞捎绊�。另外計算所用基組方法的那個也會由影響。還有就是實驗也沒有標出ee值。 參見如下： 第一，由于采用的基組不是完備基組，計算精度不夠高，第二，計算的假定條件為氣相孤立分子，氣相孤立分子的分子間距較大，而實驗測定則在溶液中，分子間距較近，此外，計算的旋光度僅是最穩(wěn)定構(gòu)象體的，還有一些亞穩(wěn)定的構(gòu)象體，原則上需要采用波子曼分布來求各種可能構(gòu)象體的旋光度貢獻總和。第三，在實驗上測定旋光度時，沒有指出過量對映異構(gòu)體的（ee，Excess Enantiomer）含量，也沒有指出光學異構(gòu)體之間能否相互轉(zhuǎn)化。如果樣品含有一定量的外消旋體，測定的旋光度定然會偏小。 |
2樓2011-08-28 21:11:50
kekexiliwolf
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4樓2013-12-04 08:43:59
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非常感謝樓主kekexiliwolf及時的回復(fù)！ 我對用Gaussian程序直接提交工作任務(wù)很不熟悉，因此想繼續(xù)問您幾個用GaussianView提交工作任務(wù)的幾個問題： 1.是不是計算ECD(電子圓二色譜)和ORD(旋光度或比旋光度)時， “Job tye”選項的下拉菜單中，都必須選“Frequency”? 2. Gaussian中文手冊關(guān)于“Freq”計算中有一句話：“推薦的方法是在前一個幾何優(yōu)化的結(jié)構(gòu)上，使用同樣的方法進行頻率計算。”我們在做結(jié)構(gòu)優(yōu)化時，“Method“第一個選項的下拉菜單中，選擇的是“Ground State”。我想問：在計算ECD和ORD時，是否必須選“Ground State”，還是也可以選“TD-SCF”? 3. 在計算ORD時，在“additional keywords”中輸入“Polar=OptRot，cphf=rdfreq ”，還是只輸入“Polar=OptRot”就可以了？ 4. 如果只想計算589nm波長下的ORD，如何在additional keywords輸入相關(guān)的數(shù)值？是輸入5890.0（您的計算結(jié)果中以A（埃）為單位的數(shù)值），還是輸入0.077357（您提到的“常用的鈉燈是0.077357”的數(shù)值）？ 5.您提到的“常用的鈉燈是0.077357”的數(shù)值，請問能否告知這個數(shù)值和589nm這個值之間的轉(zhuǎn)換關(guān)系？ 6. 讀過“Gaussian中文手冊”，“Exploring Chemistry with Electronic Structure Method”，還有郭勇的“高斯使用指南”，這些書中關(guān)于如何計算ECD和ORD的內(nèi)容非常少，不知道樓主能否分享一些這方面計算的資料？或者給點建議也行？ 本人知識淺薄，問題有點多，可能還非常膚淺，但是求助無門，只能向樓主求救了！ |
5樓2013-12-04 14:48:38
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