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3‘RACE inner PCR 電泳結(jié)果總是有彌散現(xiàn)象回收條帶不成帶狀什么原因? 已有11人參與
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采用65度退火溫度跑兩輪3‘RACE PCR 電泳條帶多條,并且最大的條帶上面很大的彌散帶,用的是TAKARA 3‘RACE試劑盒,設(shè)計(jì)兩條上游特異性引物相差117bp,設(shè)計(jì)原則按照說(shuō)明書(shū)來(lái)的,想問(wèn)問(wèn)做過(guò)3‘RACE的前輩們,這到底什么原因?圖1為pcr結(jié)果,圖2為切膠回收結(jié)果。 |
新蟲(chóng) (初入文壇)
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怎么,我看不了你的圖片啊! 我提幾點(diǎn)建議吧! 1、3‘RACE 的引物一般在60度以上,而且兩條引物TM值要相差幾度。以便改變兩輪PCR的退火溫度。 2、兩輪巢式PCR的退火溫度也要有差異,第二輪PCR退火溫度要比第一輪高。以便減少非特異性擴(kuò)增。 3、第一輪的PCR循環(huán)數(shù)25輪就OK拉,以便減少非特異擴(kuò)增。 4、第一輪PCR的產(chǎn)物一般稀釋5~20倍作為第二輪PCR的模板,以便減少非特異的產(chǎn)物模板。 |
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