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sinokang至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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[求助]
Amber計算復(fù)合物中配體，受體各自的RMSD值
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跑了10ns蛋白-蛋白對接后復(fù)合物的動力學(xué)，想分別計算一下配體，受體獨自的RMSD值，配體的殘基序列號是1-609，受體為610-988，請問RMSD腳本應(yīng)該怎樣寫呢？ trajin .. reference .. rms first out bb.rmsd @CA, C, N time 1 |
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