版塊導(dǎo)航: 正在加載中...

應(yīng)《網(wǎng)絡(luò)安全法》要求，自2017年10月1日起，未進(jìn)行實(shí)名認(rèn)證將不得使用互聯(lián)網(wǎng)跟帖服務(wù)。為保障您的帳號(hào)能夠正常使用，請(qǐng)盡快對(duì)帳號(hào)進(jìn)行手機(jī)號(hào)驗(yàn)證，感謝您的理解與支持！

24小時(shí)熱門版塊排行榜

返回列表

下一頁(yè)

kelvinpolyu

銅蟲(chóng) (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 86.5
帖子: 5
在線: 9.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 1471878
注冊(cè): 2011-11-02
專業(yè): 無(wú)機(jī)非金屬類光電信息與功

[求助] 請(qǐng)問(wèn)96G的內(nèi)存, 12核, 2.66GHz 的電腦配置, CASTEP能計(jì)算最多的原子數(shù) ？

請(qǐng)問(wèn)96G的內(nèi)存, 12核, 2.66GHz 的電腦配置, CASTEP 能計(jì)算最多的原子數(shù) ？計(jì)算時(shí)間? 謝謝

回復(fù)此樓

1樓 2011-11-03 02:52:18

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

回帖支持 ( 顯示支持度最高的前 50 名 )

avast2009

榮譽(yù)版主 (職業(yè)作家)

努力、勤奮！

應(yīng)助: 283 (大學(xué)生)
貴賓: 7.101
金幣: 21634.9
散金: 12799
紅花: 189
沙發(fā): 25
帖子: 4391
在線: 1867.6小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 850954
注冊(cè): 2009-09-18
性別: GG
專業(yè): 金屬材料的制備科學(xué)與跨學(xué)
管轄: 論文投稿

【答案】應(yīng)助回帖

★
zzy870720z(金幣+1): 鼓勵(lì)交流經(jīng)驗(yàn)，但下次希望注意說(shuō)話方式，呵呵 2011-11-03 20:19:03

靠，這配置應(yīng)該很猛了
我4核，8G跑80多個(gè)原子要三天，感覺(jué)你這個(gè)應(yīng)該能算更多原子吧

贊一下(2人)

回復(fù)此樓

2樓2011-11-03 09:22:09

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

renmingjun

銀蟲(chóng) (小有名氣)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 56.4
散金: 110
帖子: 93
在線: 369小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 808299
注冊(cè): 2009-07-13
性別: MM
專業(yè): 金屬非晶態(tài)、準(zhǔn)晶和納米晶

引用回帖:

2樓: Originally posted by avast2009 at 2011-11-03 09:22:09:
靠，這配置應(yīng)該很猛了
我4核，8G跑80多個(gè)原子要三天，感覺(jué)你這個(gè)應(yīng)該能算更多原子吧

您好！我是一個(gè)新手，以前沒(méi)怎么接觸過(guò)MS，老板想搞計(jì)算，主要做燃料電池催化劑，計(jì)算內(nèi)容為過(guò)渡金屬催化劑的DOS，也有可能應(yīng)用DMOL3進(jìn)行小分子催化分解的相關(guān)計(jì)算，不知道要怎么樣的配置才能合適啊?

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

4樓2011-11-03 11:21:18

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lbambool

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

1ST強(qiáng)帖: 7
應(yīng)助: 35 (小學(xué)生)
金幣: 3755.1
散金: 2648
紅花: 27
帖子: 2403
在線: 393.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 96218
注冊(cè): 2005-11-06
性別: GG
專業(yè): 無(wú)機(jī)非金屬材料

【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
zzy870720z(金幣+2): 謝謝指教 2011-11-03 20:20:09
kelvinpolyu(金幣+1): 2011-11-06 00:05:23

能算多少原子主要由內(nèi)存大小決定，算多久主要由CPU數(shù)量和主頻決定，同時(shí)兩方面又都和體系的電子復(fù)雜程度和計(jì)算精度有關(guān)，一般來(lái)說(shuō)，96G內(nèi)存castep可以算600-800個(gè)原子吧，簡(jiǎn)單的一點(diǎn)的估計(jì)可以算到1000個(gè)，不過(guò)12個(gè)核心，算600個(gè)可能就得十天左右或更長(zhǎng)吧。200-500個(gè)原子一般用不了一個(gè)月，除非你精度設(shè)置特別高。
CPU：內(nèi)存按1：8配，這是標(biāo)準(zhǔn)配置

贊一下(2人)

回復(fù)此樓

» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）

yuanleishi

Θ撫琴鬧市外，獨(dú)閑山水間Θ

8樓2011-11-03 14:27:52

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

sunboyccc

鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

應(yīng)助: 79 (初中生)
金幣: 5418.4
紅花: 10
帖子: 352
在線: 182.6小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 674686
注冊(cè): 2008-12-14
性別: GG
專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)

★
uuv2010(金幣+1): 歡迎參加討論 2011-12-15 13:13:16

引用回帖:

13樓: Originally posted by souledge at 2011-12-14 20:10:57:
具體的內(nèi)存分配方式可以看CASTEP的輸出文件，里面有提到總共多少個(gè)node參與計(jì)算，這些node又被分為多少個(gè)group，而每個(gè)node的平均使用內(nèi)存為多少。
如果用過(guò)PWscf的話，應(yīng)該能體會(huì)到，這個(gè)差別是在于pool的個(gè)數(shù) ...

呵呵，我只是就“單機(jī)計(jì)算”說(shuō)一說(shuō)，并且不同的軟件（或相同軟件不同版本）或不同系統(tǒng)情況又不同啦，沒(méi)有涉及小型機(jī)多節(jié)點(diǎn)計(jì)算。
我的感覺(jué)：?jiǎn)螜C(jī)、windows系統(tǒng)的情況下，同樣是四核或六核CPU，主頻越高、性能越好的CPU，需內(nèi)存越多，對(duì)6核2.66GCPU來(lái)說(shuō)，可能對(duì)每個(gè)核配置8G內(nèi)存就夠，但對(duì)六核3.33GCPU來(lái)說(shuō)，每個(gè)核需配置16G內(nèi)存，這就像大師傅需要大的操作空間一個(gè)道理。
此外，計(jì)算效率方面，眾所周知Linux強(qiáng)于Windows，所需內(nèi)存又不一樣，所以配置計(jì)算用單機(jī)要綜合考慮，希望以上對(duì)一些蟲(chóng)友能有幫助。
關(guān)于Castep輸出文件中可以看到內(nèi)存使用情況應(yīng)該是在配完機(jī)器后，在使用Castep計(jì)算后的結(jié)果里面出現(xiàn)，那是后話啦。越說(shuō)越多。。。不好意思

贊一下(3人)

回復(fù)此樓

14樓2011-12-14 22:05:44

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

souledge

專家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)

專家經(jīng)驗(yàn): +174
1ST強(qiáng)帖: 19
應(yīng)助: 303 (大學(xué)生)
金幣: 11306.4
散金: 1123
紅花: 108
帖子: 2814
在線: 916.1小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 941486
注冊(cè): 2010-01-12
專業(yè): 結(jié)構(gòu)陶瓷
管轄: 第一性原理

★ ★ ★
uuv2010(金幣+1): 歡迎參加討論 2011-12-15 13:13:28
fzx2008(金幣+2): 謝謝指教 2011-12-15 13:25:13

引用回帖:

14樓: Originally posted by sunboyccc at 2011-12-14 22:05:44:
呵呵，我只是就“單機(jī)計(jì)算”說(shuō)一說(shuō)，并且不同的軟件（或相同軟件不同版本）或不同系統(tǒng)情況又不同啦，沒(méi)有涉及小型機(jī)多節(jié)點(diǎn)計(jì)算。
我的感覺(jué)：?jiǎn)螜C(jī)、windows系統(tǒng)的情況下，同樣是四核或六核CPU，主頻越高、性能越 ...

這就是說(shuō)得單機(jī)計(jì)算啊……只不過(guò)在CASTEP和VASP中都是使用node來(lái)表示一個(gè)并行進(jìn)程，而在PWscf、Abinit中則是使用Processor來(lái)表示的而已~
盡管軟件之間的設(shè)計(jì)各有不同，但是總的來(lái)說(shuō)對(duì)內(nèi)存的使用規(guī)則是一定的，那就是分node（或者processor）并行，并且在node數(shù)足夠多時(shí)為減少對(duì)同一個(gè)內(nèi)存有過(guò)多進(jìn)程進(jìn)行讀寫(xiě)，再分組成為不同池的方法。
而作為一個(gè)DFT軟件，其內(nèi)存的占用僅僅與K點(diǎn)和K點(diǎn)需要展開(kāi)的平面波數(shù)密切相關(guān)。當(dāng)然，可能還需要點(diǎn)其他的開(kāi)銷，這些開(kāi)銷在K點(diǎn)和平面波面前就幾乎可以忽略了，下面是典型的平面波贗勢(shì)方法的內(nèi)存開(kāi)銷結(jié)構(gòu)：

CODE:

     Largest allocated arrays     est. size (Mb)     dimensions

        Kohn-Sham Wavefunctions         1.34 Mb     (   4004,  22)

        NL pseudopotentials             1.47 Mb     (   4004,  24)

        Each V/rho on FFT grid          1.19 Mb     (  77760)

        Each G-vector array             0.24 Mb     (  32031)

        G-vector shells                 0.01 Mb     (   1535)

     Largest temporary arrays     est. size (Mb)     dimensions

        Auxiliary wavefunctions         5.38 Mb     (   4004,  88)

        Each subspace H/S matrix        0.12 Mb     (     88,  88)

        Each  matrix      0.01 Mb     (     24,  22)

        Arrays for rho mixing           9.49 Mb     (  77760,   8)

     Initial potential from superposition of free atoms

     starting charge   34.99996, renormalised to   36.00000

     Starting wfc are   26 atomic wfcs

     total cpu time spent up to now is     84.16 secs

     per-process dynamical memory:    22.7 Mb

所以，對(duì)于給定的系統(tǒng)，其內(nèi)存需求是有上限的，并不是說(shuō)隨便給個(gè)體系，只要加足夠多的內(nèi)存，就能足夠的快一樣（當(dāng)然，很多不懂系統(tǒng)的人，總以為對(duì)于只使用2GB內(nèi)存的前提下，8GB內(nèi)存會(huì)比4GB內(nèi)存快）。
所以，如果一定要說(shuō)同核前提下，高頻的CPU會(huì)使用更多內(nèi)存，那就只有可能是使用過(guò)程中程序根據(jù)CPU速度自動(dòng)判斷了分組情況，增加了內(nèi)存池的數(shù)目而已。這個(gè)信息在castep輸出文件中，完全不算后話。
至于在Windows下和*nix下的速度問(wèn)題。以CASTEP來(lái)說(shuō)，給出了三種（5.5開(kāi)始大概是四種）運(yùn)行模式，其中不使用任何硬盤空間作為緩存的為speed方式。但是就是這個(gè)方式，在Windows下運(yùn)行時(shí)，如果內(nèi)存不是非常多，并且使用的比較古老的對(duì)內(nèi)存管理比較失敗的系統(tǒng)（比如XP），那系統(tǒng)就不會(huì)完全把程序請(qǐng)求的空間分配在物理內(nèi)存中，而是選擇了一部分放在虛擬內(nèi)存中。對(duì)程序本身來(lái)說(shuō)，這兩個(gè)部分沒(méi)有區(qū)別，但是從實(shí)際來(lái)說(shuō)，這跟選擇default甚至memory方法運(yùn)行本質(zhì)上區(qū)別不大，于是速度變慢。而在*nix下，則是嚴(yán)格先分配物理內(nèi)存，只有不足時(shí)才會(huì)分配到swap空間，所以*nix下時(shí)，swap空間一般都一直是0%的占用率。
另外，Windows的shell和kernel直接一體化的設(shè)計(jì)，在圖形方面響應(yīng)很好，但是在分配計(jì)算工作時(shí)就非常痛苦，所以如果用Windows版的Abinit時(shí)，如果使用所有核心計(jì)算，系統(tǒng)會(huì)卡頓得非常嚴(yán)重，不管CPU是不是很牛X，但是同樣的計(jì)算在Linux下就流暢得多。
DFT及DFT軟件的計(jì)算機(jī)使用本身是有些不確定性，但是這些不確定性都是在一定的理論范圍內(nèi)的，不至于像LS所說(shuō)的那樣懸忽。
最后，不得不說(shuō)，支持“內(nèi)存決定能否計(jì)算，CPU決定計(jì)算時(shí)間”的說(shuō)法，這個(gè)從DFT程序的設(shè)計(jì)來(lái)說(shuō)是完全合理的論斷。

贊一下(3人)

回復(fù)此樓

思想重于技巧，內(nèi)涵重于表象

15樓2011-12-15 01:23:11

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

普通回帖

香水百合519

鐵蟲(chóng) (小有名氣)

應(yīng)助: 3 (幼兒園)
金幣: 1333.1
帖子: 242
在線: 72.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 1160325
注冊(cè): 2010-12-01
性別: MM
專業(yè): 人工晶體

【答案】應(yīng)助回帖

★
zzy870720z(金幣+1): 鼓勵(lì)交流 2011-11-03 20:19:17

這個(gè)配置算肯定很快了不過(guò)castep自身算不了太多原子與電腦配置沒(méi)多大關(guān)系吧

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

3樓2011-11-03 10:43:06

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

kelvinpolyu

銅蟲(chóng) (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 86.5
帖子: 5
在線: 9.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 1471878
注冊(cè): 2011-11-02
專業(yè): 無(wú)機(jī)非金屬類光電信息與功

這配置原子數(shù)200 or 500 可以嗎? 在30天可以算完嗎? 謝謝

贊一下

回復(fù)此樓

5樓2011-11-03 12:23:04

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

avast2009

榮譽(yù)版主 (職業(yè)作家)

努力、勤奮！

應(yīng)助: 283 (大學(xué)生)
貴賓: 7.101
金幣: 21634.9
散金: 12799
紅花: 189
沙發(fā): 25
帖子: 4391
在線: 1867.6小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 850954
注冊(cè): 2009-09-18
性別: GG
專業(yè): 金屬材料的制備科學(xué)與跨學(xué)
管轄: 論文投稿

★
uuv2010(金幣+1): 歡迎參加討論 2011-12-15 13:15:14

引用回帖:

4樓: Originally posted by renmingjun at 2011-11-03 11:21:18:
您好！我是一個(gè)新手，以前沒(méi)怎么接觸過(guò)MS，老板想搞計(jì)算，主要做燃料電池催化劑，計(jì)算內(nèi)容為過(guò)渡金屬催化劑的DOS，也有可能應(yīng)用DMOL3進(jìn)行小分子催化分解的相關(guān)計(jì)算，不知道要怎么樣的配置才能合適啊?

看你要算的原子數(shù)量吧，我用的是服務(wù)器，主要是性能穩(wěn)定，如果單機(jī)的話，可能i7可能就是不錯(cuò)的cpu了，內(nèi)存盡量大些

贊一下(2人)

回復(fù)此樓

6樓2011-11-03 13:46:57

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

444239852

銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

應(yīng)助: 20 (小學(xué)生)
金幣: 275.9
散金: 40
紅花: 1
帖子: 555
在線: 268小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 1146976
注冊(cè): 2010-11-15
性別: GG
專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)

【答案】應(yīng)助回帖

★
zzy870720z(金幣+1): 鼓勵(lì)交流 2011-11-03 20:19:28

我覺(jué)得你這個(gè)配置太猛那
起碼得算一兩百個(gè)也沒(méi)問(wèn)題呀

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

7樓2011-11-03 14:22:16

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lbambool

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

1ST強(qiáng)帖: 7
應(yīng)助: 35 (小學(xué)生)
金幣: 3755.1
散金: 2648
紅花: 27
帖子: 2403
在線: 393.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 96218
注冊(cè): 2005-11-06
性別: GG
專業(yè): 無(wú)機(jī)非金屬材料

【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
zzy870720z(金幣+2): 謝謝指點(diǎn) 2011-11-03 20:20:35

引用回帖:

DOS計(jì)算量稍小一些，如果體系不大的話用PC也可以了，ｉ７　２６００（ｋ）的CPU，主頻３.４G，配16G內(nèi)存，現(xiàn)在一臺(tái)5000可以配好，配兩臺(tái)或4臺(tái)組個(gè)集群情能比同價(jià)位的服務(wù)器要好，當(dāng)錢，如果組里有錢的話就上樓主的雙路6 核的服務(wù)器，小品牌的3萬(wàn)-4萬(wàn)，名牌的估計(jì)5萬(wàn)多吧。
一句話，看錢說(shuō)話。

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

Θ撫琴鬧市外，獨(dú)閑山水間Θ

9樓2011-11-03 14:31:38

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

avast2009

榮譽(yù)版主 (職業(yè)作家)

努力、勤奮！

應(yīng)助: 283 (大學(xué)生)
貴賓: 7.101
金幣: 21634.9
散金: 12799
紅花: 189
沙發(fā): 25
帖子: 4391
在線: 1867.6小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 850954
注冊(cè): 2009-09-18
性別: GG
專業(yè): 金屬材料的制備科學(xué)與跨學(xué)
管轄: 論文投稿

引用回帖:

8樓: Originally posted by lbambool at 2011-11-03 14:27:52:
能算多少原子主要由內(nèi)存大小決定，算多久主要由CPU數(shù)量和主頻決定，同時(shí)兩方面又都和體系的電子復(fù)雜程度和計(jì)算精度有關(guān)，一般來(lái)說(shuō)，96G內(nèi)存castep可以算600-800個(gè)原子吧，簡(jiǎn)單的一點(diǎn)的估計(jì)可以算到1000個(gè)，不過(guò)12 ...

你好，算100個(gè)原子，幾何優(yōu)化的話，能量圖中曲線一直是上下擺動(dòng)，不像少原子那樣，呈越來(lái)越平滑。是不是步數(shù)設(shè)的不夠多呢，我是默認(rèn)的100步

贊一下

回復(fù)此樓

10樓2011-11-03 20:50:47

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn) 我要訂閱樓主 kelvinpolyu 的主題更新

返回列表

下一頁(yè)

普通表情龍兔虎貓

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]		作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 070300化學(xué)319求調(diào)劑 +4	錦鯉0909 2026-03-17	4/200	2026-03-17 18:21 by 重科小霸王
[考研] 材料專碩326求調(diào)劑 +6	墨煜姒莘 2026-03-15	7/350	2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 293求調(diào)劑 +6	世界首富 2026-03-11	6/300	2026-03-17 17:04 by ruiyingmiao
[考研] 求調(diào)劑，總分315，考的生物醫(yī)藥，一志愿湖南師范大學(xué)。調(diào)劑到任何專業(yè)都可以 +4	小丁想進(jìn)步 2026-03-11	5/250	2026-03-17 16:05 by 外星文明
[考研] 289求調(diào)劑 +6	步川酷紫123 2026-03-11	6/300	2026-03-17 10:23 by Sammy2
[基金申請(qǐng)] 國(guó)自科面上基金字體 +6	iwuli 2026-03-12	7/350	2026-03-16 21:18 by sculhf
[基金申請(qǐng)] 今年的國(guó)基金是打分制嗎？ 50+3	zhanghaozhu 2026-03-14	3/150	2026-03-16 17:07 by 北京萊茵潤(rùn)色
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 290分有科研經(jīng)歷，論文在投 +7	膩膩gk 2026-03-14	7/350	2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 326求調(diào)劑 +3	mlpqaz03 2026-03-15	3/150	2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考博] 東華理工大學(xué)化材專業(yè)26屆碩士博士申請(qǐng) +6	zlingli 2026-03-13	6/300	2026-03-15 20:00 by ryzcf
[考研] 085601材料工程315分求調(diào)劑 +3	yang_0104 2026-03-15	3/150	2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 080500，材料學(xué)碩302分求調(diào)劑學(xué)校 +4	初識(shí)可樂(lè) 2026-03-14	5/250	2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 中科大材料專碩319求調(diào)劑 +3	孟鑫材料 2026-03-13	3/150	2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +6	邱gl 2026-03-12	7/350	2026-03-13 23:24 by 邱gl
[考研] 求材料調(diào)劑 +5	隔壁陳先生 2026-03-12	5/250	2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] 290求調(diào)劑 +7	ADT 2026-03-12	7/350	2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求調(diào)劑，科研和技能十分豐富，求新興方向的導(dǎo)師收留 +3	土木小天才 2026-03-12	3/150	2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 277求調(diào)劑 +4	anchor17 2026-03-12	4/200	2026-03-13 11:15 by 白夜悠長(zhǎng)
[考博] 福州大學(xué)楊黃浩課題組招收2026年專業(yè)學(xué)位博士研究生，2026.03.20截止 +3	Xiangyu_ou 2026-03-12	3/150	2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考博] 2026年博士申請(qǐng) +3	QwQwQW10 2026-03-11	3/150	2026-03-12 17:58 by gxch43