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[交流] 求助序列分析BLAST最簡(jiǎn)潔的教程

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1樓 2011-11-07 21:57:42

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niyq

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77638333(金幣+10): 看了，沒(méi)有下載，因?yàn)槲覐陌俣任膸?kù)里下載過(guò)了。 2011-11-08 06:54:29
wanhscn(金幣+3): 鼓勵(lì)應(yīng)助！熱心！ 2011-11-08 08:33:41

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2樓: Originally posted by niyq at 2011-11-08 01:06:58:
我有，咋給你

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3樓2011-11-08 01:09:36

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mingzhu392

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3樓: Originally posted by niyq at 2011-11-08 01:09:36:
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謝謝您的分享！順便提個(gè)問(wèn)題。就是blast比對(duì)后的應(yīng)該怎么做。用那些比對(duì)結(jié)果進(jìn)行系統(tǒng)樹(shù)的構(gòu)建，是95%以上的嗎？還有比對(duì)結(jié)果怎么導(dǎo)出，建樹(shù)！謝謝了！

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4樓2011-11-08 09:22:24

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zhiruo1029

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5樓2011-11-08 10:55:32

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niyq

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建樹(shù)首先選取與自己序列最相似的可能屬于同種或者最近緣的序列若干，可能有99、98%的，可以多選幾個(gè)，然后依次選取同屬的其它中的典型菌株的序列、最好是模式菌株的，不要選那些模糊的、可能發(fā)表的人也不能肯定的序列，相似性依次可能是97、96、96、94的，走后也可選取較遠(yuǎn)的序列，最遠(yuǎn)的一個(gè)可以做外群

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7樓2011-11-09 00:21:25

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