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蛋白序列的BLAST
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| 我現(xiàn)在有一個(gè)鏈霉菌，但目前這個(gè)菌的基因組還沒(méi)有被注釋，現(xiàn)在這個(gè)菌的所有的可能的蛋白序列已經(jīng)被預(yù)測(cè)出來(lái)了，現(xiàn)在想從蛋白序列入手同天藍(lán)色鏈霉菌（模式菌）比對(duì)它的蛋白序列，得到我的這個(gè)菌中的蛋白信息。想問(wèn)的是我如何將我的菌的蛋白序列同天藍(lán)色鏈霉菌的蛋白序列對(duì)比，最好是批量對(duì)比，了解我的菌中的蛋白有哪些是可以知道功能的（具體是什么功能，催化什么反應(yīng)），哪些是不知道的？還望各位了解這方面的多多指教~！ |
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jmcookie: 金幣+1, ★有幫助, 不知道這個(gè)能不能實(shí)現(xiàn)批量Blast，我先試試，謝謝你哦 2013-10-19 09:00:13
| http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... LAST_INIT=GlobalAln你試試這個(gè)，這是NCBI中的一個(gè)蛋白比對(duì)工具，我不常用這個(gè)，希望對(duì)你有用 |
2樓2013-10-19 07:29:06
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| ExPASy是一個(gè)專業(yè)分析蛋白的網(wǎng)站，由瑞士生物信息研究所（SIB）維護(hù)，可對(duì)蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)及2-D電泳數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。在網(wǎng)站上，依據(jù)不同目的，有很多工具可供選擇。網(wǎng)址為http://www.expasy.org/。生物信息學(xué)課上老師講的。 |
3樓2013-10-19 09:59:32
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5樓2013-10-21 08:39:37
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