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[求助]
蛋白序列的BLAST
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| 我現(xiàn)在有一個鏈霉菌，但目前這個菌的基因組還沒有被注釋，現(xiàn)在這個菌的所有的可能的蛋白序列已經(jīng)被預(yù)測出來了，現(xiàn)在想從蛋白序列入手同天藍色鏈霉菌（模式菌）比對它的蛋白序列，得到我的這個菌中的蛋白信息。想問的是我如何將我的菌的蛋白序列同天藍色鏈霉菌的蛋白序列對比，最好是批量對比，了解我的菌中的蛋白有哪些是可以知道功能的（具體是什么功能，催化什么反應(yīng)），哪些是不知道的？還望各位了解這方面的多多指教~！ |
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jmcookie: 金幣+1, ★有幫助, 不知道這個能不能實現(xiàn)批量Blast，我先試試，謝謝你哦 2013-10-19 09:00:13
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| http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... LAST_INIT=GlobalAln你試試這個，這是NCBI中的一個蛋白比對工具，我不常用這個，希望對你有用 |
2樓2013-10-19 07:29:06
【答案】應(yīng)助回帖
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| ExPASy是一個專業(yè)分析蛋白的網(wǎng)站，由瑞士生物信息研究所（SIB）維護，可對蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)及2-D電泳數(shù)據(jù)進行分析。在網(wǎng)站上，依據(jù)不同目的，有很多工具可供選擇。網(wǎng)址為http://www.expasy.org/。生物信息學(xué)課上老師講的。 |
3樓2013-10-19 09:59:32
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