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zhugezilong木蟲 (著名寫手)
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[求助]
分子對稱性的選擇問題
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我最近想分析一下一個多酸化合物Mo6O19的分子軌道并計算其吸收光譜。這個分子是個-2價的分子，Mo是正6價，O為-2價，是正六面體結(jié)構(gòu)，分子對稱性為Oh。在這個分子中其中有個氧分子是位于正六面體的體心位置的，和6個鉬都有共價鍵作用。 我用晶體cif文件選取分子坐標，然后用gaussview將其處理成Oh對稱性，并在優(yōu)化過程中讓其保持對稱性不變，用rb3lyp/3-21G進行優(yōu)化，電荷為-2，S為1，結(jié)果優(yōu)化后的得到的Oh構(gòu)型中存在三個一樣的虛頻。 1 2 3 T1G T1G T1G Frequencies -- -160.3709 -160.3709 -160.3709 Red. masses -- 22.9099 22.9099 22.9099 Frc consts -- 0.3472 0.3472 0.3472 IR Inten -- 0.0000 0.0000 0.0000 如果把虛頻坐標加到優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)中后再進行優(yōu)化的話，虛頻消除了，但是分子的對稱性就從Oh變?yōu)榱薈1。如果限定為Oh對稱性的話，總是會出現(xiàn)三個一樣的虛頻。 我想研究這個分子的吸收光譜和激發(fā)態(tài)。我想問下，我應(yīng)該采用沒有虛頻的C1對稱性結(jié)構(gòu)去計算TD-DFT，還是應(yīng)該采用帶有虛頻的Oh對稱性結(jié)構(gòu)呢？ 有辦法在保持高對稱性的同時來消除虛頻嗎？ 非常感謝。 Mo6O19結(jié)構(gòu) [ Last edited by zhugezilong on 2011-11-18 at 22:09 ] |
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