 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3260 | 回復(fù): 13 | ||||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||||
heapyssb木蟲 (著名寫手)
|
[求助]
PSI-BLAST怎樣輸出蛋白序列的PSSM打分矩陣
|
|||
|
最近在研究PSSM方面的問題，新手入門，很多東西都不明白，還希望精通這方面的學(xué)者給予幫助啊。先謝謝大家了。 我在網(wǎng)上也找了很多相關(guān)的資料，但基本上啊是沒找到我想要的。 很多人用blastpgp能得到這個(gè)pssm的打分舉證，但是我在ncbi上下載本地版的blast安裝后，在bin文件夾里面沒有找到這個(gè)blastpgp課執(zhí)行文件�。╞last版本為blast-2.2.25+） 很多文獻(xiàn)報(bào)道PSI-BLAST得到profile（我不知道這個(gè)單詞怎么翻譯跟準(zhǔn)確），那個(gè)這個(gè)profile和pssm有聯(lián)系嗎？ 可能是我對pssm具體是指什么還不是很明白，希望能有人幫下我，具體的說明下跟怎樣使用現(xiàn)在這個(gè)版本的blast得到被測序列的pssm值。 |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 工具 | source |
» 猜你喜歡
317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
332求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
材料專碩 085600求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
0703化學(xué)/290求調(diào)劑/本科經(jīng)歷豐富/工科也可
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
283求調(diào)劑（080500）
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
材料工程專碩求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料專碩調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
求調(diào)劑 有機(jī)化學(xué)考研356分
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
環(huán)境科學(xué)與工程334分求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
考研調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 一條成熟mRNA可否翻譯兩條蛋白？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 研究細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路，建立細(xì)胞系，是否一定要敲出細(xì)胞內(nèi)源性蛋白分子？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 為什么用胰蛋白酶消化細(xì)胞？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 用SwissModel預(yù)測只能得到蛋白質(zhì)的一大部分的三維結(jié)構(gòu)，why？
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 組氨酸標(biāo)簽重組蛋白純化
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 公司返回的雙向測通的序列個(gè)人如何拼接�。�
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
已經(jīng)有9人回復(fù)
- SDS裂解獲得的蛋白可否用于IP
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 如何得到一個(gè)奇異矩陣的線性無關(guān)的行號
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 請問如何編寫一個(gè)能進(jìn)行序列比對的小軟件？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 請教用molpro打印氫分子離子的重疊積矩陣、單電子積分矩陣、偶極矩陣
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 菜鳥求助——著急求助解答：在NCBI上為什么下載不了FASTA格式的基因序列
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 榛子蛋白提取方法
已經(jīng)有12人回復(fù)
流風(fēng)易逝
鐵桿木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 7997
- 散金: 60
- 紅花: 9
- 帖子: 347
- 在線: 250.3小時(shí)
- 蟲號: 1446441
- 注冊: 2011-10-17
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物信息學(xué)
7樓2011-12-05 15:18:21
heapyssb(金幣+2): 2011-12-02 18:53:57
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
2樓2011-12-02 17:36:30
heapyssb
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 4135.8
- 散金: 3994
- 紅花: 28
- 帖子: 1190
- 在線: 225.9小時(shí)
- 蟲號: 972530
- 注冊: 2010-03-16
- 專業(yè): 生物信息學(xué)
3樓2011-12-02 18:52:36
★
amisking(金幣+1): 鼓勵發(fā)帖交流。 2011-12-02 19:47:22
heapyssb(金幣+2): 2011-12-02 20:19:52
amisking(金幣+1): 鼓勵發(fā)帖交流。 2011-12-02 19:47:22
heapyssb(金幣+2): 2011-12-02 20:19:52
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
4樓2011-12-02 19:11:07
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑 +11 | 芋泥小鈴鐺 2026-03-28 | 11/550 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +6 | Lyy930824@ 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +10 | 彼岸t 2026-03-29 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 一志愿河北工業(yè)大學(xué)0817化工278分求調(diào)劑 +14 | jhybd 2026-03-23 | 19/950 |
|
|
|
[考研] 334分 一志愿武理 材料求調(diào)劑 +12 | 李李不服輸 2026-03-26 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +4 | 邱gl 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +5 | wei-5 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +6 | 家佳佳佳佳佳 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料科學(xué)與工程求調(diào)劑 +6 | 深V宿舍吧 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 320分，材料與化工專業(yè)，求調(diào)劑 +9 | 一定上岸aaa 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研]
 一志愿 西北大學(xué) 總分282 英語一62 求調(diào)劑
+7
|
18419759900 2026-03-25 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工調(diào)劑 +10 | A-哆啦Z夢 2026-03-23 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 劉柯@ 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[論文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 | Russ_ss 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[碩博家園] 北京林業(yè)大學(xué)碩導(dǎo)招生廣告 +6 | kongweilin 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +6 | Ymlll 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +4 | 柚柚yoyo 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑 +3 | 丹青奶蓋 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
085602化學(xué)工程求調(diào)劑。
+4
|
平樂樂樂 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +3 | iwinso 2026-03-23 | 3/150 |
|