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allmessup

銅蟲(chóng) (初入文壇)

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請(qǐng)問(wèn)諸位結(jié)構(gòu)生物學(xué)的高手~~是不是可以用pymol將兩個(gè)蛋白（同一family的）的某一個(gè)α-helix重疊以比較其他部分的差異呢~？

PS：我在coot上面實(shí)現(xiàn)了這個(gè)，但是把文件用pymol打開(kāi)之后發(fā)現(xiàn)兩個(gè)α-helix是平行的而沒(méi)有重疊……好吧大囧~該怎么辦呢。。。。？

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Ipsascientiapotestasest.

1樓 2011-12-02 18:37:38

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銅蟲(chóng) (初入文壇)

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樓: Originally posted by nnxqwei at 2011-12-18 15:34:11:
怎么會(huì)這樣呢？你把α-helix1和α-helix2先保存下來(lái)，再用pymol只打開(kāi)α-helix1和α-helix2，進(jìn)行A>align>α-helix2，還不行的話(huà)，你就把PDB發(fā)給我試試看吧。。。

難道是因?yàn)槲业膒ymol是教育版的所以不行么~~~~~

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Ipsascientiapotestasest.

9樓2011-12-19 22:39:25

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dolphin100

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Constanteffortscanyieldsuresuccess!

2樓2011-12-06 10:06:56

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nnxqwei

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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
wanhscn(金幣+1): 不錯(cuò)，鼓勵(lì)應(yīng)助！ 2011-12-17 09:46:53

把將兩個(gè)蛋白用pymol打開(kāi)，先選擇要重疊的不同α-helix并重新分別命名（如α-helix1和α-helix2），在右上角的α-helix1頂目中選A>align> to selection>α-helix2，就可以了吧！

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3樓2011-12-15 12:31:32

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引用回帖:

3樓: Originally posted by nnxqwei at 2011-12-15 12:31:32:
把將兩個(gè)蛋白用pymol打開(kāi)，先選擇要重疊的不同α-helix并重新分別命名（如α-helix1和α-helix2），在右上角的α-helix1頂目中選A>align> to selection>α-helix2，就可以了吧！

樓主你的問(wèn)題解決了嗎！

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4樓2011-12-17 09:11:42

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