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MVD docking后的小分子和蛋白的complex為啥在pymol里不能完全顯示？
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求助：用MVD docking后的ligand和蛋白的complex，另存為mol2文件后，用pymol怎么不能在同一窗口里打開(kāi)ligand和蛋白的結(jié)合的complex結(jié)構(gòu)呢？而且此時(shí)如要顯示sequence的話，沒(méi)有那種直接從PDB download的很長(zhǎng)的氨基酸序列了。。。為什么呢？該怎么設(shè)置才能出現(xiàn)那種經(jīng)典的小分子和蛋白結(jié)合的complex？？謝謝。 [ Last edited by ghcacj on 2011-5-2 at 14:20 ] |
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天天提示我要給別人金幣，又沒(méi)幾個(gè)回復(fù)的，系統(tǒng)你這是干嘛�。�？？！�。�！ 4樓2011-05-01 15:31:57
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8樓2011-09-05 19:13:52
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9樓2011-09-05 21:19:46
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御劍江湖(金幣+4): 謝謝 2011-09-21 21:36:59
御劍江湖(金幣+4): 謝謝 2011-09-21 21:36:59
精彩這是系統(tǒng)加的話，我收錄的是問(wèn)題錦集。有你這樣說(shuō)話的嗎？ 既然這樣，我來(lái)解決吧，也不妄系統(tǒng)給的 “帖子真精彩” 用MVD docking后的ligand和蛋白的complex，另存為mol2文件后，里面是兩個(gè)分子。 一個(gè)分子mol2文件末尾有個(gè)結(jié)束標(biāo)記 ---- ENDMDL. 你把復(fù)合物mol2文件用記事本打開(kāi)，把第一個(gè)分子末尾的ENDMDL一行去掉，保存。 這樣pyMOL就認(rèn)為是一個(gè)分子，能同時(shí)顯示蛋白和小分子。 |
10樓2011-09-05 21:39:11
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