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[求助]
關(guān)于使用Dmol3進行過渡態(tài)搜索的問題！ 已有2人參與
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本人新手 剛接觸Dmol3不久 目前正在做吸附過渡態(tài)的搜索，有幾個問題想請教大家： 1、對于吸附態(tài)軌跡文件的生成，我是把吸附前和吸附后的結(jié)構(gòu)分別進行優(yōu)化，然后分別做為反應物和生成物進行原子match，生成軌跡文件。但是我發(fā)現(xiàn)有一次有一種吸附結(jié)構(gòu)居然不能生成軌跡文件 好像說反應物和生成物的晶體參數(shù)不一致。為什么會出現(xiàn)這種情況呢？還有我經(jīng)常要手動進行一些原子match，正常嗎？ 2、對于軌跡文件進行過渡態(tài)的搜索后，出現(xiàn)錯誤 Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints Cumulative number of energy/gradient calls : 17 這個問題我在論壇上搜索過，挺多的 但是回答的大部分是反應物和生成物的結(jié)構(gòu)不對 需要調(diào)整。可是我的反應物和生成物都是優(yōu)化過的，應該是穩(wěn)定的還怎么進行調(diào)整呢？？ 3、關(guān)于反應物和生成物的優(yōu)化，我好像看過有人說過渡態(tài)搜索時一些參數(shù)設置最好和優(yōu)化時的一樣，是這樣嗎？如果我對他們都用Castep進行優(yōu)化，然后再到Dmol3進行TS搜索可以嗎？如果想較容易的搜索出過渡態(tài)那么參數(shù)應該如何設置比較好呢？ 最后還是關(guān)于這個問題 Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints Cumulative number of energy/gradient calls : 17 是不是在參數(shù)設置上有什么問題呢？ 希望大家可以指點一下�。 不勝感激~~ |
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3樓2011-12-14 15:59:24
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4樓2011-12-14 20:53:57
5樓2011-12-14 20:56:54
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