 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 3372 | 回復(fù): 14 | ||
78tengfei金蟲 (小有名氣)
龍潛深淵
|
[求助]
dmol相關(guān)問題交流學(xué)習(xí)
|
|
|
大家好，小弟初學(xué)dmol，在計算的過程中有些問題搞得不是很清楚，還希望得到各位大俠和高手的指導(dǎo)。 （1）：關(guān)于盒子的處理 結(jié)構(gòu)優(yōu)化的過程中，到底要不要點上optimized cell，點上的話能量曲線震蕩很厲害，不點的話不能保證初始盒子的正確性。能量曲線到底能不能出現(xiàn)大幅度震蕩呢？ （2）：關(guān)于模型建立問題 石墨烯建模的過程中，有“切晶面”，“刪除石墨層”和“獨立建胞”（建立P183的晶胞，加C原子）三種，三種模型建立后差距大不大，那一種方法更實用呢 （3）：關(guān)于結(jié)果的可信度方面，比如說鍵長誤差在多大屬于正常呢 （4）：關(guān)于基組的問題，GGA下計算，子基組該如何選擇呢，網(wǎng)上有人建議PBE比較可靠，不知道大家如何選擇 （5）能帶圖和dos圖的畫法，也是目前我最頭疼的問題 首先是計算能帶時所選取的路徑，我是按照石墨的路徑（去掉Z軸上的點）取得，但具體如何取點，是否能否再增加取點的個數(shù)，我搞得不是很清楚，請高手賜教。 此外，能帶圖和dos圖后期在origin是如何處理的呢（ps，我相信不止一個人為這個問題頭疼） 附圖是我做的能帶圖和dos圖（ms截圖）與文章中的對比 能帶方面：文章中提供的導(dǎo)帶和價帶差不多是對稱的，而我計算的價帶為什么在費米能級左右 DOS曲線方面，也感覺和文章差距很大。 我算的結(jié)果是不是正常，如果要修改的話，是參數(shù)問題，還是后期origin處理的問題，此外，能帶和dos分析方面該如何分析呢，主要看哪幾個參數(shù)？ 能帶分析和dos分析方面，我是新手，還希望有高人指點。 （6）如何判斷結(jié)構(gòu)優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)是否穩(wěn)定 首先是能量曲線，是不是能量曲線要平緩下降不出現(xiàn)震蕩，結(jié)果才是可信的？ 還有，很多人提到過虛頻的問題，結(jié)構(gòu)優(yōu)化過后，到底要不要計算frequency呢？ （7）關(guān)于charge的問題 結(jié)構(gòu)優(yōu)化完之后，如何計算charge，使用modify charge還是要計算性質(zhì)？ （8）關(guān)于reaction coordinate 以該圖為例，圖中的1點是怎么找到的，在dmol TSsearch里面如何實現(xiàn)的呢？ 初學(xué)dmol，問題較多，還請各位高手賜教，也希望和大家多多交流。 文章中給出的能帶圖和態(tài)密度圖 小弟ms的能帶截圖 dos截圖 反應(yīng)路徑 [ Last edited by 78tengfei on 2011-12-22 at 09:29 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
333求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
307求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
考研化學(xué)308分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
298求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
263求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
276求調(diào)劑。有半年電池和半年高分子實習(xí)經(jīng)歷
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
求調(diào)劑材料學(xué)碩080500，總分289分
已經(jīng)有21人回復(fù)
-
北科281學(xué)碩材料求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
08工學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
291 求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 請教有關(guān)DMOL3的設(shè)置問題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】MS5.0中Dmol3計算頻率問題
已經(jīng)有21人回復(fù)
- 【求助】DMol3過渡態(tài)搜索的相關(guān)問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
78tengfei
金蟲 (小有名氣)
龍潛深淵
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2595.5
- 散金: 63
- 紅花: 3
- 帖子: 147
- 在線: 175.5小時
- 蟲號: 896812
- 注冊: 2009-11-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體材料
2樓2011-12-23 15:38:52
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang(金幣+1): 多謝指教 2011-12-23 22:17:07
78tengfei(金幣+10): ★★★很有幫助 2011-12-24 09:11:24
fzx2008(金幣+1): 謝謝指教 2011-12-25 16:42:59
78tengfei: 金幣+2, ★★★很有幫助 2012-04-01 14:27:09
78tengfei: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-04-04 08:59:11
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang(金幣+1): 多謝指教 2011-12-23 22:17:07
78tengfei(金幣+10): ★★★很有幫助 2011-12-24 09:11:24
fzx2008(金幣+1): 謝謝指教 2011-12-25 16:42:59
78tengfei: 金幣+2, ★★★很有幫助 2012-04-01 14:27:09
78tengfei: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-04-04 08:59:11
|
我回答第5個問題： 你做的能帶圖的價帶頂和導(dǎo)帶底與文獻蠻相似的，往上部分應(yīng)該是empty band選擇與文獻不一樣吧，往下，有可能是k點的選擇不一樣造成的； DOS圖的趨勢也基本一樣，但文獻做DOS時，smearing值可能比你的小吧； 至于文獻中Fermi level在禁帶中，那是手動調(diào)整的結(jié)果，本征半導(dǎo)體的Fermi level位于價帶頂和導(dǎo)帶底的中間位置。 一點愚見，僅供參考 |
3樓2011-12-23 21:57:22
xiaosong2011
銀蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 252.3
- 散金: 40
- 帖子: 31
- 在線: 24.5小時
- 蟲號: 1463822
- 注冊: 2011-10-27
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體材料
10樓2012-02-28 09:23:32
78tengfei
金蟲 (小有名氣)
龍潛深淵
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2595.5
- 散金: 63
- 紅花: 3
- 帖子: 147
- 在線: 175.5小時
- 蟲號: 896812
- 注冊: 2009-11-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體材料
4樓2011-12-24 09:13:36
5樓2011-12-25 16:15:54
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang(金幣+1): 多謝交流 2011-12-25 17:01:19
78tengfei: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-04-01 14:27:46
78tengfei: 金幣+1 2012-04-02 09:19:05
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang(金幣+1): 多謝交流 2011-12-25 17:01:19
78tengfei: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-04-01 14:27:46
78tengfei: 金幣+1 2012-04-02 09:19:05
|
我回答第5個問題： 你做的能帶圖的價帶頂和導(dǎo)帶底與文獻蠻相似的，往上部分應(yīng)該是empty band選擇與文獻不一樣吧，往下，有可能是k點的選擇不一樣造成的； DOS圖的趨勢也基本一樣，但文獻做DOS時，smearing值可能比你的小吧； 至于文獻中Fermi level在禁帶中，那是手動調(diào)整的結(jié)果，本征半導(dǎo)體的Fermi level位于價帶頂和導(dǎo)帶底的中間位置。 一點愚見，僅供參考 |
6樓2011-12-25 16:59:44
fzx2008
榮譽版主 (著名寫手)
- 1ST強帖: 9
- 應(yīng)助: 272 (大學(xué)生)
- 貴賓: 1.045
- 金幣: 21814.1
- 散金: 710
- 紅花: 33
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 1808
- 在線: 1601小時
- 蟲號: 621341
- 注冊: 2008-10-09
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
- 管轄: 第一性原理
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang(金幣+2): 多謝指教 2011-12-26 09:08:16
78tengfei(金幣+5): ★★★很有幫助 2011-12-27 08:48:28
78tengfei: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-04-01 14:27:57
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang(金幣+2): 多謝指教 2011-12-26 09:08:16
78tengfei(金幣+5): ★★★很有幫助 2011-12-27 08:48:28
78tengfei: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-04-01 14:27:57
|
1.不知道你這個地方的盒子指的是什么？一般來說，在算單個原子、分子、團簇并且使用平面波方法的時候，都是擴成周期性，就是一般常說的big box，這個時候box的形狀和大小是不需要優(yōu)化的。若是普通晶體單胞是需要勾選optimized cell進行優(yōu)化的。 2.石墨烯建模，只要保證建出來是具有物理意義的石墨烯模型，都是可行的，比較通用的做法是從石墨單胞中刪掉一層。然后c方向設(shè)定成所需的“真空層”。若做吸附或摻雜，ab平面也需擴展成如3*3等等。 3.DFT計算誤差，一般來說，2%，僅供參考，可以多調(diào)研同領(lǐng)域的文獻 4.基組，這兒我看稱泛函跟合適點，具體用哪種要看體系或者參考文獻或者分別計算比較，沒有一定可靠的。只是PBE大家用的多點，但不是絕對的。 5."文章中給出的能帶圖和態(tài)密度圖"這是石墨烯的能帶圖嗎？我看應(yīng)該不是的，單純石墨烯應(yīng)該沒有g(shù)ap才。 先寫這么多，僅供參考，節(jié)日快樂！ |
7樓2011-12-25 20:04:12
78tengfei
金蟲 (小有名氣)
龍潛深淵
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2595.5
- 散金: 63
- 紅花: 3
- 帖子: 147
- 在線: 175.5小時
- 蟲號: 896812
- 注冊: 2009-11-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體材料
8樓2011-12-26 08:56:36
78tengfei
金蟲 (小有名氣)
龍潛深淵
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2595.5
- 散金: 63
- 紅花: 3
- 帖子: 147
- 在線: 175.5小時
- 蟲號: 896812
- 注冊: 2009-11-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體材料
9樓2011-12-26 08:59:12
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 78tengfei 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料與化工085600，總分304，本科有兩篇sci參與，求調(diào)劑 +4 | 幸運的醬醬 2026-03-22 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 315分，誠求調(diào)劑，材料與化工085600 +3 | 13756423260 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +6 | 十三加油 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
[考研] 260求調(diào)劑 +3 | 朱芷琳 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué)070300 學(xué)碩336求調(diào)劑 +5 | vv迷 2026-03-21 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | Auroracx 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 354求調(diào)劑 +7 | Tyoumou 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑 +4 | 沿岸有貝殼6 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工306 +4 | z1z2z3879 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料工程專碩 348分求調(diào)劑 +3 | 冬辭. 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 336求調(diào)劑 +5 | rmc8866 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +3 | Jack?k?y 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿華南師大 070300（化學(xué)）304分求調(diào)劑 +3 | 0703武芊慧雪304 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +10 | S.H1 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 22408 344分 求調(diào)劑 一志愿 華電計算機技術(shù) +4 | solanXXX 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +4 | 小材化本科 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005 +5 | ioodiiij 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 本科鄭州大學(xué)物理學(xué)院，一志愿華科070200學(xué)碩，346求調(diào)劑 +4 | 我不是一根蔥 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿蘇州大學(xué)材料工程（085601）專碩有科研經(jīng)歷三項國獎兩個實用型專利一項省級立項 +6 | 大火山小火山 2026-03-16 | 8/400 |
|