nyzhaoyin

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[交流] 同一用戶下安裝g03 g09 結(jié)果還是不行混亂了

盡管設(shè)置了不同的變量神碼的

# .bashrc

# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
      . /etc/bashrc
fi

# User specific aliases and functions
# for Gaussian.03.E01
G03ROOT=/home/yin/g03
GAUSS_EXEDIR=$G03ROOT
GAUSS_SCRDIR=/home/yin/scratch/g03
LD_LIBRARY_PATH=$G03ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH
PATH=$G03ROOT/:$PATH
export G03ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH

# for Gaussian.09.A01
# G09ROOT=/home/yin/g09
# GAUSS_EXEDIR=$G09ROOT
# GAUSS_SCRDIR=/home/yin/scratch/g09
# LD_LIBRARY_PATH=$G09ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH
# PATH=$G09ROOT/:$PATH
# export G09ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH

看上面代碼部分

只用03 我就把09前面加上# 就像上面的只用09了就把03前面加# 09前面的#去掉

我在想  是不是可以用兩個(gè)用戶？

兩個(gè)用戶的話  如果我在user1里面提交任務(wù)  然后切換到user2  再提交任務(wù)
user1里面的任務(wù)還在運(yùn)行嗎？  不太懂linux的多用戶

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1樓 2011-12-26 18:34:09

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coolrainbow

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★
nyzhaoyin(金幣+1):謝謝參與

你就非得寫到.bashrc里啊，寫個(gè)腳本在子shell里就行了

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2樓2011-12-26 20:04:10

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2樓: Originally posted by coolrainbow at 2011-12-26 20:04:10:
你就非得寫到.bashrc里啊，寫個(gè)腳本在子shell里就行了

求具體指點(diǎn) 謝謝

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3樓2011-12-26 20:13:50

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coolrainbow

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3樓: Originally posted by nyzhaoyin at 2011-12-26 20:13:50:
求具體指點(diǎn) 謝謝

你可以寫個(gè)小腳本，把里面的內(nèi)容分別改成03 09啥的，就能各自運(yùn)行了
# rung03
export g03root="/usr/local/chemsoft"
mkdir /tmp/${PBS_JOBID}
export GAUSS_SCRDIR=/tmp/${PBS_JOBID}
source $g03root/g03/bsd/g03.profile
cd your_path
g03 < $1 > $2
rm -rf /tmp/${PBS_JOBID}

比如叫a.gjf，輸出b.out，可以運(yùn)行： ./rung03 a.gjf b.out

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4樓2011-12-26 21:28:45

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nyzhaoyin

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4樓: Originally posted by coolrainbow at 2011-12-26 21:28:45:
你可以寫個(gè)小腳本，把里面的內(nèi)容分別改成03 09啥的，就能各自運(yùn)行了
# rung03
export g03root="/usr/local/chemsoft"
mkdir /tmp/${PBS_JOBID}
export GAUSS_SCRDIR=/tmp/${PBS_JOBID}
source $ ...

非常感謝

對(duì)了你這個(gè)腳本我用了很好不過就是運(yùn)行腳本后也是一直等到任務(wù)算完才會(huì)跳出新的$命令行有啥辦法修改嗎？

[ Last edited by nyzhaoyin on 2011-12-27 at 00:30 ]

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5樓2011-12-26 23:56:31

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coolrainbow

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g03 < $1 > $2 &

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6樓2011-12-27 08:24:41

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6樓: Originally posted by coolrainbow at 2011-12-27 08:24:41:
g03 < $1 > $2 &

加上&后出錯(cuò)了。。。。

03 出現(xiàn)：

forrtl: No such file or directory
forrtl: severe (29): file not found, unit 11, file /tmp/test2/Gau-8114.inp
Image             PC             Routine          Line       Source
g03             00000000004AED6E  Unknown             Unknown  Unknown
g03             00000000004ADF6A  Unknown             Unknown  Unknown
g03             00000000004446AA  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000418E6A  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000418476  Unknown             Unknown  Unknown
g03             000000000042BB8E  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000405C29  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000404C02  Unknown             Unknown  Unknown
libc.so.6       0000003C8AA1ECDD  Unknown             Unknown  Unknown
g03             0000000000404B29  Unknown             Unknown  Unknown

09出現(xiàn)：

PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /tmp/test/Gau-8120.inp
In source file ml0.f, at line number 182

去掉&都正常了

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7樓2011-12-27 12:00:00

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補(bǔ)充下：
不使用腳本使用修改.bashrc文件的方法加&沒問題

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8樓2011-12-27 12:03:03

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abdoman

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引用回帖:

7樓: Originally posted by nyzhaoyin at 2011-12-27 12:00:00:

加上&后出錯(cuò)了。。。。

03 出現(xiàn)：

forrtl: No such file or directory
forrtl: severe (29): file not found, unit 11, file /tmp/test2/Gau-8114.inp
Image PC ...

那你就
rung03 a.inp b.out &
在這后面加個(gè) &
就可以了

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9樓2011-12-27 18:37:54

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