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請問下面兩個序列中是否含有Kozaka序列
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請問下面兩個序列中是否含有Kozaka序列，如何識別Kozaka序列？ 1、CCGTAAGTTTTACCAACAGACTGCAGTTTCTTCACTACCAAA 2、ACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAACGAGAAACGTAAAATGATATAAATATCAATATATTAAATTAGATTTTGCATAAAAAACAGACTACATAATACTGTAAAACACAACATATCCAGTCACTATG |
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yicao917(金幣+1):謝謝參與
小丹木木(金幣+1): 學習了，你本來金幣就很多了，我就少給點了 2012-01-04 08:38:52
小丹木木: 是專家顧問啊，我是剛來的，還不是很熟悉各位前輩啊 2012-01-04 08:42:10
小丹木木(金幣+1, 專家考核): 補上額 2012-01-05 15:48:04
yicao917(金幣+1):謝謝參與
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小丹木木(金幣+1, 專家考核): 補上額 2012-01-05 15:48:04
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KOZAK是一個女科學家，她研究過起始密碼子ATG周邊堿基定點突變后對轉(zhuǎn)錄和翻譯所造成的影響，并總結出在真核生物中，起始密碼子兩端序列為：——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——，如GCCACCATGG、GCCATGATGG時，轉(zhuǎn)錄和翻譯效率最高，特別是-3位的A對翻譯效率非常重要。該序列被后人稱為Kozak序列，并被應用于表達載體的構建中。 所謂Kozak規(guī)則，即第一個ATG側(cè)翼序列的堿基分布所滿足的統(tǒng)計規(guī)律，若將第一個ATG中的堿基A，T，G分別標為1，2，3位，則Kozak規(guī)則可描述如下： (1)第4位的偏好堿基為G； (2)ATG的5’端約15bp范圍的側(cè)翼序列內(nèi)不含堿基T； (3)在-3，-6和-9位置，G是偏好堿基； (4)除-3，-6和-9位，在整個側(cè)翼序列區(qū)，C是偏好堿基。 Kozak規(guī)則是基于已知數(shù)據(jù)的統(tǒng)計結果，不見得必須全部滿足，一般來說，滿足前兩項即可。 From  XY經(jīng)查，你序列里應沒有 |
2樓2012-01-03 20:55:47
3樓2012-01-03 22:11:07
4樓2012-01-04 07:22:40
5樓2012-01-04 18:58:27
6樓2012-01-04 21:25:30
7樓2012-01-05 14:22:02
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