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yicao917

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[交流] 請(qǐng)問(wèn)下面兩個(gè)序列中是否含有Kozaka序列

請(qǐng)問(wèn)下面兩個(gè)序列中是否含有Kozaka序列，如何識(shí)別Kozaka序列？
1、CCGTAAGTTTTACCAACAGACTGCAGTTTCTTCACTACCAAA

2、ACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAACGAGAAACGTAAAATGATATAAATATCAATATATTAAATTAGATTTTGCATAAAAAACAGACTACATAATACTGTAAAACACAACATATCCAGTCACTATG

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1樓 2012-01-03 15:59:23

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dnaxxx

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yicao917(金幣+1):謝謝參與
小丹木木(金幣+1): 感謝應(yīng)助哦，簡(jiǎn)潔明了又易懂 2012-01-04 08:44:49

kozak序列簡(jiǎn)單可以簡(jiǎn)單地描述為ANNATGG，基本上是真核生物起始密碼子的最優(yōu)環(huán)境。其它序列不是不可以翻譯，但是翻譯效率可能差很多

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4樓2012-01-04 07:22:40

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cdl007

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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小丹木木(金幣+1): 學(xué)習(xí)了，你本來(lái)金幣就很多了，我就少給點(diǎn)了 2012-01-04 08:38:52
小丹木木: 是專家顧問(wèn)啊，我是剛來(lái)的，還不是很熟悉各位前輩啊 2012-01-04 08:42:10
小丹木木(金幣+1, 專家考核): 補(bǔ)上額 2012-01-05 15:48:04

KOZAK是一個(gè)女科學(xué)家，她研究過(guò)起始密碼子ATG周邊堿基定點(diǎn)突變后對(duì)轉(zhuǎn)錄和翻譯所造成的影響，并總結(jié)出在真核生物中，起始密碼子兩端序列為：——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——，如GCCACCATGG、GCCATGATGG時(shí)，轉(zhuǎn)錄和翻譯效率最高，特別是-3位的A對(duì)翻譯效率非常重要。該序列被后人稱為Kozak序列，并被應(yīng)用于表達(dá)載體的構(gòu)建中。

所謂Kozak規(guī)則，即第一個(gè)ATG側(cè)翼序列的堿基分布所滿足的統(tǒng)計(jì)規(guī)律，若將第一個(gè)ATG中的堿基A，T，G分別標(biāo)為1，2，3位，則Kozak規(guī)則可描述如下：

(1)第4位的偏好堿基為G；
(2)ATG的5’端約15bp范圍的側(cè)翼序列內(nèi)不含堿基T；
(3)在-3，-6和-9位置，G是偏好堿基；
(4)除-3，-6和-9位，在整個(gè)側(cè)翼序列區(qū)，C是偏好堿基。

Kozak規(guī)則是基于已知數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果，不見(jiàn)得必須全部滿足，一般來(lái)說(shuō)，滿足前兩項(xiàng)即可。

From

XY

經(jīng)查，你序列里應(yīng)沒(méi)有

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2樓2012-01-03 20:55:47

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yicao917

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引用回帖:

樓: Originally posted by cdl007 at 2012-01-03 20:55:47:
KOZAK是一個(gè)女科學(xué)家，她研究過(guò)起始密碼子ATG周邊堿基定點(diǎn)突變后對(duì)轉(zhuǎn)錄和翻譯所造成的影響，并總結(jié)出在真核生物中，起始密碼子兩端序列為：——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——，如GCCACCATGG、GCCATGATGG時(shí)，轉(zhuǎn)錄和翻譯 ...

好的，謝謝，不過(guò)第二個(gè)序列是人體內(nèi)有的可以表達(dá)的額

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3樓2012-01-03 22:11:07

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引用回帖:

樓: Originally posted by dnaxxx at 2012-01-04 07:22:40:
kozak序列簡(jiǎn)單可以簡(jiǎn)單地描述為ANNATGG，基本上是真核生物起始密碼子的最優(yōu)環(huán)境。其它序列不是不可以翻譯，但是翻譯效率可能差很多

若同時(shí)存在兩個(gè)翻譯起始區(qū)會(huì)如何？

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5樓2012-01-04 18:58:27

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