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小白如水鐵桿木蟲 (小有名氣)
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[求助]
Amber tools 中的antechamber 必須要在安裝了amber11的前體下才能使用么?
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我想得到乙烯在amber力場(chǎng)下的鍵和參數(shù)，看到有人說(shuō)antechamber可以得到這些參數(shù)，自己下了antechamber發(fā)現(xiàn)不能用，原來(lái)antechamber是ambertools的一部分，要有ambertool才可以，我又去下了ambertools，安裝好發(fā)現(xiàn)還是不能用，照著說(shuō)明說(shuō)第一步的reduce sustiva.pdb > sustiva_h.pdb 和antechamber antechamber -i sustiva_new.pdb -fi pdb -o sustiva.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2 都找不到指令。難道必須有amber11才行么？amber11是收費(fèi)的啊。。好郁悶 求大家?guī)兔Α?br /> 或者誰(shuí)幫我用antechamber算一下乙烯的amber力場(chǎng)參數(shù)，我有量化算好的乙烯的pdb文件。 不勝感激！ |
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2樓2012-01-08 08:38:48
fmtzhangli
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3樓2012-01-08 18:19:58
小白如水
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4樓2012-01-08 19:06:21
5樓2012-02-17 13:20:02
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