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cenwanglai榮譽版主 (知名作家)
老和山猥瑣派九段
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[求助]
Guassian和VASP計算過渡態(tài)的原理和算法上差別在哪里？
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VASP是在周期性模型中，用string, elastic band等模型來描述反應(yīng)路徑的。實際上是分析勢能面上的能量走勢。 Gaussian怎么算過渡態(tài)呢？是不是一樣的原理？有什么差別？ |
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VASP和Gaussian所用到的搜索過渡態(tài)、確定IRC的方法在這里詳細討論過 http://hi.baidu.com/sobereva/blo ... Stamp=1326195337907 http://hi.baidu.com/sobereva/blo ... ee62da572c841f.html string、NEB這類方法，獲得的是勢能面上兩個極小點之間的最小能量路徑，以化學的角度來說，就是一次性將IRC和過渡態(tài)同時確定了。原理可以簡單描述為將一串珠子的兩端分別固定在勢能面上反應(yīng)物和產(chǎn)物的位置上，然后讓這串珠子自行弛豫，最后這串珠子就描述出了最小能量路徑（或稱IRC），而這個路徑也經(jīng)過了過渡態(tài)位置。 實際上在Gaussian中path=N的方法也可以達到同樣的目的，但是原理還是很不同的。 在Gaussian中用的方法都是人為指定（opt=ts）或者以自動方式（QST2,QST3）給出初猜位置，然后通過不同的迭代方法（berny、GEDIIS等）從這個初猜位置逐漸收斂到過渡態(tài)位置。若再想獲得IRC則從過渡態(tài)位置開始順著虛頻矢量方向以不同方法做迭代。 無論是VASP還是Gaussian用的方法，研究的都是勢能面結(jié)構(gòu)，只不過算法的思路有本質(zhì)不同。原理上講，VASP的那些方法可以用在Gaussian上，Gaussian的方法也能用在VASP里。 |
6樓2012-01-10 19:50:17
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