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ppx523新蟲 (初入文壇)
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[求助]
跪求Clustalx漢化綠色版及說明
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請問哪位朋友有Clustalx漢化綠色版及說明啊，急用�。。�！十分感謝！ |
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用ClustalX做多序列比對分析圖示 1、打開程序 如下圖所示： 2、Load Sequnce, 載入序列 如下圖所示： 3、選擇序列文件，F(xiàn)ASTA格式的 如下圖所示： 4、用文本編輯器察看FASTA序列文件內(nèi)容，這里用的是記事本，推薦用EditPlus或者Ultraedit 如下圖所示： 5、序列Load進(jìn)去之后 如下圖所示： 6、Do Complete Alignment, 通常情況下直接選這個(gè)即可，無須修改比對參數(shù) 如下圖所示： 7、點(diǎn)Do Complete Alignment之后彈出的文件對話框，.dnd的是輸出的指導(dǎo)樹文件，.aln的是序列比對結(jié)果，它們都是純文本文件 如下圖所示： 點(diǎn)“ALIGN”之后開始等待，如果序列不多，很快就可以算完，如果數(shù)據(jù)很多，可能要等一段時(shí)間，這時(shí)候可以用眼睛盯著ClustalX的狀態(tài)欄，那里會(huì)有程序運(yùn)行狀態(tài)和現(xiàn)在正在比對那兩條序列的提示信息，看看可以消磨時(shí)間。。。 8、比對結(jié)束之后，我們可以看到這個(gè)結(jié)果 如下圖所示： 9、這時(shí)候我們可以發(fā)現(xiàn)ClustalX已經(jīng)生成了.dnd和.aln兩個(gè)文件，仍然用文本編輯器打開來看，這時(shí).aln文件，這個(gè)文件可以用Mega2做進(jìn)一步的bootstrap進(jìn)化樹分析 如下圖所示： 10、這是.dnd文件（指導(dǎo)樹） 如下圖所示： 11、可以用Treeview打開dnd文件，看上去就像這樣子 如下圖所示： |
2樓2012-02-05 13:35:51
jiaxinfish
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【答案】應(yīng)助回帖
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2012-02-05 13:37:12, 218 K
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ppx5233樓2012-02-05 13:37:17
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6樓2012-06-21 22:30:46
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7樓2013-04-18 10:43:05
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