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ppx523新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
跪求Clustalx漢化綠色版及說(shuō)明
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請(qǐng)問(wèn)哪位朋友有Clustalx漢化綠色版及說(shuō)明啊,急用。。!十分感謝! |
新蟲(chóng) (正式寫手)
金蟲(chóng) (正式寫手)
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用ClustalX做多序列比對(duì)分析圖示 1、打開(kāi)程序 如下圖所示: 2、Load Sequnce, 載入序列 如下圖所示: 3、選擇序列文件,F(xiàn)ASTA格式的 如下圖所示: 4、用文本編輯器察看FASTA序列文件內(nèi)容,這里用的是記事本,推薦用EditPlus或者Ultraedit 如下圖所示: 5、序列Load進(jìn)去之后 如下圖所示: 6、Do Complete Alignment, 通常情況下直接選這個(gè)即可,無(wú)須修改比對(duì)參數(shù) 如下圖所示: 7、點(diǎn)Do Complete Alignment之后彈出的文件對(duì)話框,.dnd的是輸出的指導(dǎo)樹(shù)文件,.aln的是序列比對(duì)結(jié)果,它們都是純文本文件 如下圖所示: 點(diǎn)“ALIGN”之后開(kāi)始等待,如果序列不多,很快就可以算完,如果數(shù)據(jù)很多,可能要等一段時(shí)間,這時(shí)候可以用眼睛盯著ClustalX的狀態(tài)欄,那里會(huì)有程序運(yùn)行狀態(tài)和現(xiàn)在正在比對(duì)那兩條序列的提示信息,看看可以消磨時(shí)間。。。 8、比對(duì)結(jié)束之后,我們可以看到這個(gè)結(jié)果 如下圖所示: 9、這時(shí)候我們可以發(fā)現(xiàn)ClustalX已經(jīng)生成了.dnd和.aln兩個(gè)文件,仍然用文本編輯器打開(kāi)來(lái)看,這時(shí).aln文件,這個(gè)文件可以用Mega2做進(jìn)一步的bootstrap進(jìn)化樹(shù)分析 如下圖所示: 10、這是.dnd文件(指導(dǎo)樹(shù)) 如下圖所示: 11、可以用Treeview打開(kāi)dnd文件,看上去就像這樣子 如下圖所示: |
新蟲(chóng) (初入文壇)
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