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bqbcx木蟲 (正式寫手)
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MOFs簇合物的拓?fù)浣馕鼋Y(jié)果
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最近在研究 Zn MOFs簇合物的拓?fù)浣馕�，所解析的Zn MOFs簇合物中只有一種有機(jī)橋連配體，結(jié)構(gòu)分析表明，其MOFs簇合物單元（subs）連接了19個(gè)有機(jī)配體。以此MOFs簇合物單元為節(jié)點(diǎn)，topos 拓?fù)浣馕鼋Y(jié)果也顯示MOFs簇合物節(jié)點(diǎn)連接數(shù)是19。 請問MOFs簇合物的拓?fù)浣馕鼋Y(jié)果中的連接數(shù)目，是否一定要與MOFs簇合物單元（subs）中的連接配體數(shù)目一致？如果不一致，是不是表明拓?fù)浣馕鼋Y(jié)果錯(cuò)誤？（注意：前提條件是只含有一種有機(jī)橋連配體） |
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首先謝謝這位網(wǎng)友的應(yīng)助，具體情形是這樣的： 單晶結(jié)構(gòu)分析表明，其中一個(gè)晶體是由7個(gè)金屬M(fèi)（其中包括對稱操作產(chǎn)生的金屬）為中心所形成的3D結(jié)構(gòu)。進(jìn)一步分析表明，7個(gè)M被5個(gè)羥基所橋連。如果以M7O5作為金屬簇節(jié)點(diǎn)，則該節(jié)點(diǎn)又被周圍19個(gè)有機(jī)橋連配體所連接。分別以M7O5、有機(jī)橋連配體作為節(jié)點(diǎn)，通過topos軟件操作發(fā)現(xiàn)，其拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)是M-19連接的。 通過文獻(xiàn)查閱可知：M-8、M-9、M-10、M-11、M-12、M-13、M-14、M-16、M-24、M-36連接的MOFs都有文獻(xiàn)報(bào)道（也不知文獻(xiàn)報(bào)道是否正確，其疑點(diǎn)源于一個(gè)前輩所說“不同的節(jié)點(diǎn)選擇，一定會(huì)有不同的拓?fù)浣Y(jié)果”）。 而本結(jié)構(gòu)中的節(jié)點(diǎn)選擇應(yīng)該沒有問題, 只是出現(xiàn)的“M-19連接”是個(gè)罕見物。而對于其它類似晶體來說，我采用同樣的topos拓?fù)涮幚矸椒�，得出的拓�(fù)浣Y(jié)果也都顯現(xiàn)出同樣的規(guī)律，即MOFs簇合物的拓?fù)浣馕鼋Y(jié)果中的連接數(shù)目，都與MOFs簇合物單元（subs）中的連接配體數(shù)目一致。只不過，這些晶體所得出的topos結(jié)果中連接數(shù)都有文獻(xiàn)報(bào)道過（如6、8、10等）。所以在“19連接”這個(gè)罕見物出現(xiàn)之前，我一直沒有對自己的topos拓?fù)涮幚矸椒ǖ恼_性產(chǎn)生懷疑。 正如應(yīng)助者所言，M7O5節(jié)點(diǎn)周圍的19個(gè)有機(jī)橋連配體，有部分配體同時(shí)橋連到另一個(gè)周圍的M7O5簇上，但這種情況是不是也很正常的啊，否則此有機(jī)配體（即另一個(gè)節(jié)點(diǎn)）就不會(huì)稱為橋連配體了（當(dāng)然了，此有機(jī)配體一定有別于羥基）。 另外，如何理解“應(yīng)該檢查是否橋連周圍19個(gè)金屬簇”？ |
6樓2012-02-05 22:15:26
mashulin
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【答案】應(yīng)助回帖
bqbcx(金幣+6): ★★★★★最佳答案 2012-02-06 02:00:54
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"應(yīng)該檢查是否橋連周圍19個(gè)金屬簇"是基于你所用的有機(jī)配體是不是線性二橋連配體而言的，如果有機(jī)配體是線性二橋連的，就可以把M7O5作為節(jié)點(diǎn)來簡化結(jié)構(gòu)，再如果每個(gè)M7O5周圍橋連19個(gè)M7O5的話，你的結(jié)構(gòu)就是一個(gè)單節(jié)19連接拓?fù)洹?br />
但如果你的配體不是一個(gè)線性二橋連配體，那么簡化時(shí)就應(yīng)該把配體也算作一種節(jié)點(diǎn)，那么拓?fù)渚筒皇且粋�(gè)單節(jié)拓?fù)洹？赡苁且粋�(gè)（n，19）的網(wǎng)絡(luò)。就是這個(gè)意思。 我分析，你的拓?fù)浜芸赡苁且粋�(gè)多節(jié)的拓?fù)�，比如�?,19）或（4,19）的拓?fù)洹? |
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7樓2012-02-06 00:29:58
bqbcx
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送鮮花一朵 |
非常感謝網(wǎng)友wbulu 的詳細(xì)解答。 我用的不是線性二橋連配體，在topos 處理時(shí)，也是把此配體作為一種節(jié)點(diǎn)的。正如你所說，其拓?fù)涫且粋�(gè)三節(jié)的拓?fù)�，即拓�(fù)渲械耐慌潴w有兩種不同的連接方式。而且我又通過其結(jié)構(gòu)圖分析發(fā)現(xiàn)，對于金屬簇合物節(jié)點(diǎn)與配體節(jié)點(diǎn)來說，它們的拓?fù)浣Y(jié)果都顯現(xiàn)出同樣的規(guī)律，即MOFs的拓?fù)浣馕鼋Y(jié)果中的金屬簇合物節(jié)點(diǎn)與配體節(jié)點(diǎn)的連接數(shù)目，都與它們作為節(jié)點(diǎn)單元（subs）時(shí)的連接數(shù)目一致。 請教網(wǎng)友，這是否說明我所做的topos 拓?fù)浞治鰯?shù)據(jù)（包括拓?fù)浞柕龋┦钦_的？ |
8樓2012-02-06 01:58:00
tangfan00189
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9樓2013-07-09 15:26:07
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