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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 材料區(qū) » 晶體 » 晶體解析 » MOFs簇合物的拓撲解析結果
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bqbcx木蟲 (正式寫手)
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MOFs簇合物的拓撲解析結果
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最近在研究 Zn MOFs簇合物的拓撲解析，所解析的Zn MOFs簇合物中只有一種有機橋連配體，結構分析表明，其MOFs簇合物單元（subs）連接了19個有機配體。以此MOFs簇合物單元為節(jié)點，topos 拓撲解析結果也顯示MOFs簇合物節(jié)點連接數(shù)是19。 請問MOFs簇合物的拓撲解析結果中的連接數(shù)目，是否一定要與MOFs簇合物單元（subs）中的連接配體數(shù)目一致？如果不一致，是不是表明拓撲解析結果錯誤？（注意：前提條件是只含有一種有機橋連配體） |
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2樓2012-02-05 14:40:36
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bqbcx
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首先謝謝這位網(wǎng)友的應助，具體情形是這樣的： 單晶結構分析表明，其中一個晶體是由7個金屬M（其中包括對稱操作產(chǎn)生的金屬）為中心所形成的3D結構。進一步分析表明，7個M被5個羥基所橋連。如果以M7O5作為金屬簇節(jié)點，則該節(jié)點又被周圍19個有機橋連配體所連接。分別以M7O5、有機橋連配體作為節(jié)點，通過topos軟件操作發(fā)現(xiàn)，其拓撲結構是M-19連接的。 通過文獻查閱可知：M-8、M-9、M-10、M-11、M-12、M-13、M-14、M-16、M-24、M-36連接的MOFs都有文獻報道（也不知文獻報道是否正確，其疑點源于一個前輩所說“不同的節(jié)點選擇，一定會有不同的拓撲結果”）。 而本結構中的節(jié)點選擇應該沒有問題, 只是出現(xiàn)的“M-19連接”是個罕見物。而對于其它類似晶體來說，我采用同樣的topos拓撲處理方法，得出的拓撲結果也都顯現(xiàn)出同樣的規(guī)律，即MOFs簇合物的拓撲解析結果中的連接數(shù)目，都與MOFs簇合物單元（subs）中的連接配體數(shù)目一致。只不過，這些晶體所得出的topos結果中連接數(shù)都有文獻報道過（如6、8、10等）。所以在“19連接”這個罕見物出現(xiàn)之前，我一直沒有對自己的topos拓撲處理方法的正確性產(chǎn)生懷疑。 正如應助者所言，M7O5節(jié)點周圍的19個有機橋連配體，有部分配體同時橋連到另一個周圍的M7O5簇上，但這種情況是不是也很正常的啊，否則此有機配體（即另一個節(jié)點）就不會稱為橋連配體了（當然了，此有機配體一定有別于羥基）。 另外，如何理解“應該檢查是否橋連周圍19個金屬簇”？ |
6樓2012-02-05 22:15:26
wbulu
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【答案】應助回帖
bqbcx(金幣+6): ★★★★★最佳答案 2012-02-06 02:00:54
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"應該檢查是否橋連周圍19個金屬簇"是基于你所用的有機配體是不是線性二橋連配體而言的，如果有機配體是線性二橋連的，就可以把M7O5作為節(jié)點來簡化結構，再如果每個M7O5周圍橋連19個M7O5的話，你的結構就是一個單節(jié)19連接拓撲。 但如果你的配體不是一個線性二橋連配體，那么簡化時就應該把配體也算作一種節(jié)點，那么拓撲就不是一個單節(jié)拓撲�？赡苁且粋�（n，19）的網(wǎng)絡。就是這個意思。 我分析，你的拓撲很可能是一個多節(jié)的拓撲，比如（3,19）或（4,19）的拓撲。 |
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7樓2012-02-06 00:29:58
bqbcx
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送鮮花一朵 |
非常感謝網(wǎng)友wbulu 的詳細解答。 我用的不是線性二橋連配體，在topos 處理時，也是把此配體作為一種節(jié)點的。正如你所說，其拓撲是一個三節(jié)的拓撲，即拓撲中的同一配體有兩種不同的連接方式。而且我又通過其結構圖分析發(fā)現(xiàn)，對于金屬簇合物節(jié)點與配體節(jié)點來說，它們的拓撲結果都顯現(xiàn)出同樣的規(guī)律，即MOFs的拓撲解析結果中的金屬簇合物節(jié)點與配體節(jié)點的連接數(shù)目，都與它們作為節(jié)點單元（subs）時的連接數(shù)目一致。 請教網(wǎng)友，這是否說明我所做的topos 拓撲分析數(shù)據(jù)（包括拓撲符號等）是正確的？ |
8樓2012-02-06 01:58:00
tangfan00189
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