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藍紫色玻璃心新蟲 (小有名氣)
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[求助]
trr文件如何輸出
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| 進行模擬的時候沒有讓輸出trr文件，但是現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)要用到那個文件，用什么樣的命令可以得到這個文件呢，望指點 |
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藍紫色玻璃心
新蟲 (小有名氣)
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送鮮花一朵 
5樓2012-02-10 10:45:17
2樓2012-02-10 09:46:35
藍紫色玻璃心
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3樓2012-02-10 09:49:29
【答案】應(yīng)助回帖
藍紫色玻璃心(金幣+5): 2012-02-14 11:54:09
御劍江湖(模擬EPI+1): 謝謝 2012-02-17 22:11:39
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也就是說你想接著上一步的模擬，繼續(xù)增加模擬時間，是這樣吧？ 如果你的初始MDP文件中設(shè)置的模擬時間就很長，沒有算完，想繼續(xù)往下算的話，直接讀入前一個斷點（.cpt文件）就行了 ，在的mdrun 命令中加入-cpi 就可以把最初始設(shè)置的模擬時間算完。這中情況不需要.trr文件。 如果你初的MDP文件中設(shè)置的模擬時間已經(jīng)算完了，想繼續(xù)模擬下去，就更簡單了，把你上一步得到的.gro文件作為繼續(xù)模擬的初始結(jié)構(gòu)，就可以了啊。也不需要以前的.trr 文件，如果你以后需要的話，可以在繼續(xù)模擬的MDP文件中讓.trr 文件輸出出來。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
4樓2012-02-10 09:58:38
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