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樂(lè)逍遙741金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
BSSE校正
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我做離解能時(shí)用的都是Ezpe值,審稿人建議我替換為free energies evaluating thermal and entropic corrections, 在另外一條意見(jiàn)中提到過(guò)最好用BSSE校正。請(qǐng)問(wèn),兩條意見(jiàn)是否矛盾?我查到的 E(校正相互作用能)=E(相互作用能)+BSSE,E(相互作用能)=E(AB)-E(AO)-E(BO), 請(qǐng)問(wèn)E(AB)、E(AO)、E(BO)應(yīng)取什么值?是否可以取審稿人建議的“free energies evaluating thermal and entropic corrections”? 謝謝! |
木蟲(chóng) (正式寫手)
| 直接取總自由能即可:Sum of electronic and thermal Free Energies= -414.321919 |
木蟲(chóng) (正式寫手)
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不矛盾。BSSE是基組疊加引起的誤差,而free energy則是對(duì)熱效應(yīng)和熵效應(yīng)的校正,完全不同來(lái)源的校正。 E(AB)、E(AO)、E(BO)就是分別優(yōu)化AB, A和B得到的總能。當(dāng)然最好取free energies with thermal and entropic corrections。 |
金蟲(chóng) (小有名氣)
木蟲(chóng) (正式寫手)
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1. 對(duì)頭。 2. 合理不合理,要看熱力學(xué)和熵校正與BSSE的關(guān)系。 首先HF總能,或MP2總能,相當(dāng)于分子的內(nèi)能U;而熱力學(xué)校正,即焓的計(jì)算是H=U+PV, 自由能G=H-TS,其中熵S是把分子看作剛體計(jì)算轉(zhuǎn)動(dòng)和平動(dòng)熵,并在簡(jiǎn)諧近似下計(jì)算左右的振動(dòng)熵,另外考慮電子熵。其中振動(dòng)熵的貢獻(xiàn)占90%以上。進(jìn)行BSSE,相當(dāng)于是對(duì)焓的內(nèi)能部分進(jìn)行修正;而內(nèi)能修正不影響其他計(jì)算結(jié)果。 當(dāng)然,振動(dòng)熵顯然是基于BSSE校正前的能量進(jìn)行二階微分得到的,這一部分包含BSSE的誤差無(wú)法消除,但是這個(gè)誤差應(yīng)該小到可以忽略。 因此,我認(rèn)為合理。 |
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