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zhengting000新蟲 (初入文壇)
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[求助]
NAMD中特殊bond定義問題
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我現(xiàn)在有一個疑問: 現(xiàn)在我要定義這樣一種作用形式:體系中有A-B-C排序的原子,A-B B-C 之間只有bond作用,忽略A和B之間以及B和C之間的相互作用而單純靠定義bond作用來約束距離,A-C之間的相互作用要忽略 在同一個體系中 我定義D-E-F,同樣D-E之間 E-F之間的相互作用力忽略且單純靠定義的bond作用來約束,但是,此時我要求A-C之間的相互作用不能忽略 NAMD能不能實現(xiàn)這種要求?該怎么定義實現(xiàn)呢? 謝謝 |
木蟲 (小有名氣)
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