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lzn_t木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
怎樣在DMol3 結(jié)構(gòu)優(yōu)化中使構(gòu)型基本保持不變?
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現(xiàn)已知同一物質(zhì)存在兩種不同結(jié)構(gòu)a和b,已知晶胞(supercell)在不帶電荷時(shí)a結(jié)構(gòu)更為穩(wěn)定;帶有+1電荷時(shí)b更穩(wěn)定。問(wèn)題是:b結(jié)構(gòu)的supercell在電中性下優(yōu)化所得結(jié)果會(huì)變?yōu)閍結(jié)構(gòu)的supercell,但我需要得到b構(gòu)型在電中性時(shí)的最優(yōu)supercell,該如何實(shí)現(xiàn)? [ Last edited by lzn_t on 2012-2-20 at 17:37 ] |
木蟲(chóng) (小有名氣)
金蟲(chóng) (小有名氣)
專家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
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專家經(jīng)驗(yàn): +174 |
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不知道LZ對(duì)于“基本構(gòu)型”的理解是怎樣的,這個(gè)詞匯很曖昧,很難量化表示。 如果說(shuō)是比例尺一樣放大縮小,但各原子之間的空間對(duì)稱關(guān)系保持不變,可以用分?jǐn)?shù)坐標(biāo)固定;如果說(shuō)要各原子的絕對(duì)距離都不變,就要迪卡爾坐標(biāo)固定。 相應(yīng)的,還有在某軸向上固定其他軸向上變動(dòng)之類的。 如果LZ想要的是,可以稍微構(gòu)造變化一點(diǎn),但是不要變化太多。比如正方體變成底比高為100:99的四方也可以接受,但是如果變成了不一定什么樣子的結(jié)構(gòu)就不能接受的話,那LZ就對(duì)電腦的智能期待太高了,或者,LZ的行為已經(jīng)類似于“向著自己想要的結(jié)果上取優(yōu)化”,從而與造結(jié)果沒(méi)什么區(qū)別了…… |

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結(jié)構(gòu)優(yōu)化的原則應(yīng)該是尊重實(shí)驗(yàn)結(jié)構(gòu),也就是優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)與優(yōu)化前的結(jié)構(gòu)(實(shí)驗(yàn)結(jié)構(gòu))越接近越好,如果出入太大,就得檢查優(yōu)化的設(shè)置,或則程序本身了。如果真如樓主所說(shuō),結(jié)構(gòu)優(yōu)化能夠產(chǎn)生這樣大的結(jié)構(gòu)調(diào)整,樓主應(yīng)該檢查一下設(shè)置了。 PS: 個(gè)人覺(jué)得,樓主的描述是在考察我們的思辨能力,a和b是同一物質(zhì),已經(jīng)說(shuō)明a的supercell在電中性時(shí)最穩(wěn)定,b的supercell在帶一個(gè)單位電荷時(shí)最穩(wěn)定,那么在電中性條件下優(yōu)化b的supercell,得到a的supercell有什么好奇怪的?我想程序想告訴你a的supercell就是電中性條件下b的最優(yōu)supercell 樓主最好說(shuō)的具體點(diǎn),a和b的差異是什么? |
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