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muxiachuixue

木蟲 (正式寫手)

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專業(yè): 合成藥物化學(xué)

[求助] 固定原子坐標(biāo)優(yōu)化出錯，方法試盡，繼續(xù)求助高手

至今未解決，繼續(xù)發(fā)帖求助！
課題是蛋白酶催化小分子反應(yīng)過渡態(tài)的研究，我從蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)里提取出氨基酸殘基，加入反應(yīng)物，組成初始構(gòu)象，用HF/6-31g+(d,p)優(yōu)化，為了使氨基酸殘基在優(yōu)化過程中不至于偏離晶體結(jié)構(gòu)太多，我用modredundant固定了一些原子的坐標(biāo)，但優(yōu)化到第九步報錯：
Old curvilinear step not converged, using linear step
Error imposing constraints
Error termination via Lnk1e in /home/g09c01/g09/l103.exe at Mon Feb 20 14:13:47 2012.

以下附上我的gjf文件和out文件，問三個問題:
1.為何會報錯？而且我發(fā)現(xiàn)我所固定的幾個原子，在優(yōu)化過程中相對距離發(fā)生了較小變化，并沒完全固定，為何？
2.用gaussview5.0打開out文件，出現(xiàn)：Unresolvable inconsistency between charge and multiplicity and orbital occupancies.Orbital data will be ignored.我的電荷設(shè)為-4，自旋多重度是1，應(yīng)該沒錯啊，怎么會如此報錯？
3.用gaussview5.0打開out文件，出現(xiàn)：Invalid ModRedundant coordinate detected on line 180. It will be removed.請問這是為何？
此問題已困擾我多日，各種固定原子的方法我都試了，但基本上還是會出現(xiàn)類似的問題，求教大俠，感激不盡�。�！

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附件 1 : UGT-Phenol_HF_initial1.gjf

2012-02-20 19:47:23, 5.11 K

附件 2 : UGT-Phenol_HF_initial1.out

2012-02-20 19:47:25, 495.57 K

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以無法為有法，以無限為有限

1樓 2012-02-20 19:48:19

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智能機(jī)器人

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