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零度不結(jié)冰新蟲 (小有名氣)
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Anneal 優(yōu)化結(jié)構(gòu)的問題 已有1人參與
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探討一個(gè)問題，文獻(xiàn)中講到通過MS Focite Anneal得到優(yōu)化后的構(gòu)型，但是在Anneal優(yōu)化的過程中，得到的兩個(gè)xtd的軌跡文件，一個(gè)是name.xtd一個(gè)是name anneal.xtd，請(qǐng)問這兩個(gè)里面分別包含的是那幾步過程的軌跡。在選取最優(yōu)構(gòu)型時(shí)是通過計(jì)算比較Hamiltonian大小排序選擇，還是通過計(jì)算total energy計(jì)算選擇。 還有一個(gè)問題，就是在進(jìn)行Anneal的過程中Geometry Optimization這個(gè)選項(xiàng)勾選上對(duì)結(jié)果有什么影響，定義中GO過程是對(duì)每一步Anneal cycle產(chǎn)生的low energy 進(jìn)行Minimize然后輸出，不知道這種結(jié)果和不選擇G.O相比較會(huì)有什么不同呢，或者說GO過程是如何優(yōu)化構(gòu)型的呢？ |
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