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生成熱(HF)結(jié)果與其中氫鍵作用力等分析結(jié)果相反,求解。
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大家好: 我對某藥和環(huán)糊精的包合物進行NBO計算.結(jié)果打開計算結(jié)果的文本框后發(fā)現(xiàn): 在文本的最后結(jié)果中R構(gòu)型的HF=-5363.6520546,S構(gòu)型的HF=-5363.64425. 那按理來說應(yīng)該R型的穩(wěn)定些。(和實驗結(jié)果也符合) 結(jié)果在做其中氫鍵、靜電作用、偶極作用分析的時候,問題來了。 1.氫鍵分析中,S構(gòu)型的E(2)略微比R構(gòu)型的大些,當然這一塊我自己本身也還存在懷疑,因為關(guān)于氫鍵的數(shù)據(jù)我有些拿捏不準應(yīng)該選那些。是應(yīng)該選E(2)>2.09KJ/MOL的,還是只要符合能形成氫鍵的都選上。如果是后者的話,那就太多了,象o....H-O,F(xiàn)....H-O,特別是C-H.....H-C。 2.然后是靜電作用,我把包合物中的小分子拿出來,然后算出小分子的總電荷,結(jié)果R是 -0.00497 ,S是-0.01196(原本未包結(jié)的小分子電荷為0) ,根據(jù)每0.0001個電荷轉(zhuǎn)移相當于4。18709KJ/MOL能量,那不是S>R? 3.然后是偶極相互作用R=12.0947 , S=14.7282 . 請高手幫我分析分析到底是哪里出了問題,謝謝。 |

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