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[交流] 氨基酸與鋅的親和力問題

幫朋友請教一個問題。

請問各位大俠。
哪些氨基酸與過渡金屬鋅的親和力最強呢？

謝謝。

[ 來自科研家族生物醫(yī)藥家族 ]

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1樓 2012-03-08 22:07:12

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brightfuture01

木蟲之王 (文壇精英)

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這個單從氨基酸這點上考慮應該是看電荷的，帶的負電荷越多，與陽離子結(jié)合能力越強。但是從蛋白角度來考慮，就要考慮接觸面整體帶電情況了�？梢钥纯翠\指結(jié)構(gòu)方面的文獻。

祝實驗順利

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4樓2012-03-09 09:28:28

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西瓜

榮譽版主 (知名作家)

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不懂，幫頂~~

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2樓2012-03-08 23:36:39

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冼亮淀粉酶

專家顧問 (知名作家)

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暈過，不懂，不好意思。

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3樓2012-03-09 02:37:30

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yabxxh

木蟲 (正式寫手)

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癡夷子皮: 金幣+1 2012-05-05 00:42:58

同意樓上的說法，其實感覺應該可以從結(jié)構(gòu)上入手，不過我的生物化學當年學的很爛，呵呵

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5樓2012-03-09 10:26:09

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落滿夏天

銀蟲 (正式寫手)

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呵呵,很多氨基酸都可以和過渡金屬離子螯合,有氨基和羧基,金屬離子有空電子軌道的話就可以配位.樓主的這個問題我遇見過,但是所知也不甚詳,這個跟結(jié)構(gòu)有關(guān)系.比如GLY和銅離子的配位就比鐵的配位強,his配位后可能比甘氨酸還牢固.有機會研究研究下.

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6樓2012-03-09 15:54:04

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asznpb

木蟲 (正式寫手)

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鋅作為酶的輔基因子出現(xiàn)，或者和輔酶螯合在一起，鋅指蛋白神馬的，建議找本無機生物化學瞅瞅唄，挺多的這一類，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，構(gòu)象神馬的一想起來就暈&……

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7樓2012-03-09 16:29:16

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liudt1105

銅蟲 (小有名氣)

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六樓說的是有道理的，不過糾正一點，一般與鋅離子結(jié)合的都是蛋白質(zhì)利用空間結(jié)構(gòu)和所帶電荷與Zn離子螯合。如果你研究鋅類保健品，應該多考慮一下蛋白質(zhì)方面。
從常理考慮氨基酸上面應該可以水解出的負離子越多越可以吸附鋅

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8樓2012-03-09 19:07:33

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vinn87

新蟲 (初入文壇)

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你做的是氨基酸螯合鋅么？

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9樓2012-03-09 21:15:40

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江南的竹

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10樓2012-03-09 21:20:33

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癡夷子皮

版主 (文壇精英)

引用回帖:

9樓: Originally posted by vinn87 at 2012-03-09 21:15:40:
你做的是氨基酸螯合鋅么？

不是，幫朋友問的，這方面我不懂，呵呵

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11樓2012-03-09 21:27:13

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落滿夏天

銀蟲 (正式寫手)

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癡夷子皮: 金幣+1 2012-05-05 00:41:27

有些氨基酸本身沒有紫外吸收,但是與金屬離子配位后有紫外吸收,這個也需要注意,現(xiàn)在這些技術(shù)有的已經(jīng)用于飼料了,呵呵.金屬離子與酶類的東西個人理解和氨基酸與金屬離子還不一樣.因為金屬離子對酶類起的是一個激活作用,沒有金屬離子的參與,很多酶類是沒有活性的.激活原理餓哦沒有研究過,也許是電子的得失變化,樓主可以研究.祝好運.

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12樓2012-03-12 15:54:26

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癡夷子皮

版主 (文壇精英)

引用回帖:

13樓: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-26 10:14:35:
GSH

被你發(fā)現(xiàn)了。。。。

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14樓2012-03-26 10:22:27

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jacy_cheyn

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引用回帖:

14樓: Originally posted by 癡夷子皮 at 2012-03-26 10:22:27:

被你發(fā)現(xiàn)了。。。。

啥意思

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15樓2012-03-27 08:33:51

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癡夷子皮

版主 (文壇精英)

引用回帖:

15樓: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-27 08:33:51:
啥意思

= =
沒啥意思啊。
居然在這里碰到你。。。

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16樓2012-03-27 08:34:50

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jacy_cheyn

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引用回帖:

16樓: Originally posted by 癡夷子皮 at 2012-03-27 08:34:50:
= =
沒啥意思啊。
居然在這里碰到你。。。

我看到是你的帖子，就回復已你下，用ＧＳＨ是可以的

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17樓2012-03-27 08:38:00

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癡夷子皮

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引用回帖:

17樓: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-27 08:38:00:
我看到是你的帖子，就回復已你下，用ＧＳＨ是可以的

沒反應過來，現(xiàn)在知道什么意思了，謝謝哈。

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18樓2012-03-27 08:39:22

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jacy_cheyn

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18樓: Originally posted by 癡夷子皮 at 2012-03-27 08:39:22:

沒反應過來，現(xiàn)在知道什么意思了，謝謝哈。

敗給你了……現(xiàn)在知道了吧~

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19樓2012-03-28 14:12:45

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癡夷子皮

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引用回帖:

19樓: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-28 14:12:45:
敗給你了……現(xiàn)在知道了吧~

知道了。。。。嘿嘿

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20樓2012-03-28 14:17:31

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jacy_cheyn

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引用回帖:

20樓: Originally posted by 癡夷子皮 at 2012-03-28 14:17:31:
知道了。。。。嘿嘿

你的專業(yè)怎么是無神論……？

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21樓2012-03-28 15:06:06

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癡夷子皮

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21樓: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-28 15:06:06:
你的專業(yè)怎么是無神論……？

因為比較拉風

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22樓2012-03-28 15:16:29

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jacy_cheyn

鐵桿木蟲 (知名作家)

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22樓: Originally posted by 癡夷子皮 at 2012-03-28 15:16:29:
因為比較拉風

SO it is

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23樓2012-03-28 15:20:22

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miaoxiangzhi

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17樓: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-27 08:38:00
我看到是你的帖子，就回復已你下，用ＧＳＨ是可以的...

請問大俠能否講下用ＧＳＨ是可以的是什么意思我現(xiàn)在實驗也遇到同樣的問題需要將金屬離子螯合掉然后測酶活

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24樓2013-04-21 16:24:04

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我根據(jù)我在分子生物版回答的一帖補充一下這個問題。
“很多氨基酸都可以和過渡金屬離子螯合,有氨基和羧基,金屬離子有空電子軌道的話就可以配位.”這是沒有錯的。

確定配位鍵的大小，以及怎樣除去含金屬的蛋白質(zhì)的中的鋅離子的方法可以參考：
1.根據(jù)配位化學原理：與一個同樣的金屬原子或離子（在配合物種兩者都叫中心原子）形成配位鍵越多的化合物一般一旦與該金屬原子或離子形成了螯合物會越穩(wěn)定；
2.蛋白質(zhì)性形后，失去空間保護的蛋白質(zhì)螯合物中的金屬原子或離子會更容易拆解下來。
3.任何螯合物（包括鋅指蛋白）都是處于動態(tài)平衡狀態(tài)，所以螯合物中的配位鍵結(jié)合的金屬原子或離子（在配合物種兩者都叫中心原子）都不是永遠呆在螯合物（包括鋅指蛋白），所以鋅指蛋白質(zhì)可能在（至少理論上）生理條件下失去鋅離子而穩(wěn)定存在。但是如果重新表達無鋅離子的鋅指蛋白會不會形成天然蛋白，我不清楚，因為蛋白質(zhì)折疊的影響因素很多，在細胞內(nèi)至少還要考慮分子擁擠和折疊酶及分子伴侶的因素，還有我現(xiàn)在并不清楚在細胞內(nèi)的鋅指蛋白的鋅離子是不是在其他蛋白質(zhì)和酶作用下接上去的。因此，不建議重現(xiàn)表達，而建議直接使用競爭性螯合試劑去除鋅指蛋白的鋅離子。
根據(jù)第一條原理可以使用用冠醚（大環(huán)多元醚）、咕啉等伸向螯合物中的配位鍵結(jié)合的金屬原子或離子（在配合物種兩者都叫中心原子）的齒（配位鍵）比較多的化合物來競爭奪取鋅指蛋白的鋅離子，而后用超濾或者透析方法去除掉有機螯合物。

另外，還可以在溶液中加入冠醚、咕啉、EDTA等能與金屬形成螯合物的有機物的情況下，通入少量的電流，比照蛋白質(zhì)電泳的電流、電壓的10%以下的值，改變?nèi)芤旱难趸€原環(huán)境也會有利于去掉鋅指蛋白的鋅原子；之前可加入變性劑對蛋白質(zhì)變性，暴露出鋅指蛋白的鋅原子的結(jié)合位點；而后透析或者超濾去掉變性劑和螯合上從鋅指蛋白搶奪到的鋅原子的能與金屬形成螯合物的有機物，這樣應該至少可以獲得一些無鋅原子的鋅指蛋白。

不過直接電泳企圖獲得無鋅離子的鋅指蛋白不大可能，因為很難對電泳的樣品復性，就算能夠復性，沒有其他的冠醚、咕啉、EDTA等能與金屬形成螯合物的有機物的情況下，被氧化或者出來的鋅離子的行為也很難預測。因此，我不建議如此，還有上面所說的蛋白質(zhì)變性不要用熱變性，因為一般無法恢復天然態(tài)，可以用酸堿變性或者鹽酸胍或尿素變性，至少去除變性劑后能夠有些蛋白質(zhì)復性。

配位化學：
https://ishare.iask.sina.com.cn/f/20547086.html?from=like

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25樓2013-04-21 16:45:40

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凌波麗

專家顧問 (知名作家)

一般來還是蛋白質(zhì)中的組氨酸和半胱氨酸與鋅離子的結(jié)合力最強。

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26樓2013-04-21 16:47:30

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jacy_cheyn

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24樓: Originally posted by miaoxiangzhi at 2013-04-21 16:24:04
請問大俠能否講下用ＧＳＨ是可以的是什么意思我現(xiàn)在實驗也遇到同樣的問題需要將金屬離子螯合掉然后測酶活

...

我不是做生物的，呵呵，對這個沒有研究過~不好意思幫不上忙

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27樓2013-04-23 10:19:44

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Hm.AQ

新蟲 (初入文壇)

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引用回帖:

26樓: Originally posted by 凌波麗 at 2013-04-21 16:47:30
一般來還是蛋白質(zhì)中的組氨酸和半胱氨酸與鋅離子的結(jié)合力最強。

其實啊，這個親和能力可以用穩(wěn)定常數(shù)來表示，一個配體與中心原子的配合物越穩(wěn)定，穩(wěn)定常數(shù)越大，則我們可以說這個配體與中心原子親和力較強。
而比較各種氨基酸與金屬鋅的親和力大小，可以用軟硬酸堿原則來解釋，軟軟結(jié)合更強，大多數(shù)過渡金屬為軟酸，那么氨基酸中若有巰基等為軟堿的R側(cè)基，那么就比較容易與金屬形成穩(wěn)定常數(shù)大的螯合物

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回復此樓

28樓2013-12-10 21:38:31

已閱回復此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

salyting

禁蟲 (初入文壇)

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖

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29樓2014-09-16 20:16:13

已閱回復此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

簡單回復

jacy_cheyn13樓

2012-03-26 10:14 回復

癡夷子皮: 金幣+5, 謝謝哈。 2012-03-27 08:39:38
癡夷子皮: 金幣+1 2012-05-05 00:41:32

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