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[交流]
N-末端 氨基酸測序——轉膜問題
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各位蟲友: 小蟲用SDS-PAGE識別到一個分子量110kDa左右(0.75mm)膠,只是想知道N-末端20個氨基酸順序,不需要保持其活性,之后送到測序公司進行氨基酸識別。已經(jīng)在網(wǎng)上和自己實踐后進行了轉膜實驗,效果不是很理想。想和蟲友共同探討和完善轉膜方案,以便后續(xù)試驗順利進行: 我用PVDF膜進行轉膜,然后準備進行N-端氨基酸測序. 1. SDS-PAGE是還原電泳,用考馬斯藍染色條帶清晰。 1. PVDF膜放在甲醇里漂洗,去除膜中氣泡,便于蛋白轉移。 3. 轉膜緩沖液用CAPS pH11。 2. 制作三明治。用60V或100v電壓轉了一個小時,染色用立春紅S幾分鐘。 可能細節(jié)還有問題,期望蟲友和有經(jīng)驗的老師提供建議,提供詳細方案和建議。之后再進行整理,以便實驗順利進行! |
經(jīng)典資源帖 | 蛋白質(zhì)生物學實驗經(jīng)驗 |
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(1)配制CAPS[3-(環(huán)己氨基)-1-丙磺酸,3-(cyclohexylamino)-1-propanesulfonic acid]電印跡緩沖液:10×CAPS(100mmol/L):取 CAPS 22.13g,加去離子水至900mL,用2mol/L NaOH (約20mL)將pH值調(diào)至11.0,然后定容至1L,貯存于4oC。 (2)CAPS電印跡緩沖液(含10%甲醇的1×CAPS):取10×CAPS 200 mL,加甲醇200 mL,去離子水1600 mL。 (3)取出PVDF膜(Positively charged nylon,Polyvinylidene fluoride,聚偏二氟乙烯膜),用甲醇浸泡數(shù)秒鐘,然后放入CAPS電印跡緩沖液中。(注:以后的操作須防止PVDF膜干涸。如果膜變干,須重復本步驟的操作;CAPS電印跡緩沖液中的甲醇濃度范圍是0-20%,一般甲醇濃度高的緩沖液對低分子量蛋白的轉移效果好,而甲醇濃度低甚至不含甲醇的緩沖液則有利于高分子量蛋白的轉移。) (4)取出電泳凝膠,在CAPS緩沖液中浸泡5-10分鐘。 (5)將用于電印跡實驗的濾紙和海綿放入電印跡緩沖液中浸泡一下,然后按海綿、濾紙、PVDF膜、凝膠、濾紙、海綿的次序?qū)㈦娪≯E夾層裝好,并放入小型電轉槽中,用50V恒壓條件下跑空膠2-2.5小時預電泳后再上蛋白樣品進行電泳分離。在50V恒壓條件下(100-170mA)于室溫下進行電印跡轉移,轉移時間為0.5-2小時。(注:務必小心排盡凝膠和PVDF膜之間的氣泡。上述轉移條件適用于Bio-Rad小型電轉槽和分子量不太大的蛋白。在不同的實驗中,應根據(jù)具體的電轉移裝置和具體蛋白適當調(diào)整電轉移條件。例如對70kD以上的蛋白質(zhì)須延長轉移時間。) (6) 取出PVDF膜并用去離子水略為漂洗,用甲醇浸泡數(shù)秒鐘,然后進行染色。 (7) 考馬斯亮藍染色,可將0.1%考馬斯亮藍R-250溶于40%甲醇/1%乙酸,染色30-50秒(切勿超過1分鐘),用50%甲醇脫色(注意勤換脫色液),并用去離子水充分洗滌,然后即可剪下待測序的條帶,送上;瞪锛夹g公司進行蛋白質(zhì)端測序(蛋白質(zhì)序列測序系統(tǒng):ABI PROCISETM492cLC)。 |
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