 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜 |
- >論壇更新日志 (899)
- >考研 (158)
- >導(dǎo)師招生 (109)
- >蟲(chóng)友互識(shí) (57)
- >碩博家園 (13)
- >招聘信息布告欄 (12)
- >考博 (12)
- >文獻(xiàn)求助 (8)
- >休閑灌水 (7)
- >基金申請(qǐng) (6)
- >教師之家 (3)
- >找工作 (3)
- >論文投稿 (3)
- >職場(chǎng)人生 (2)
- >博后之家 (2)
- >論文道賀祈福 (2)
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3328 | 回復(fù): 10 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿(mǎn)足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話(huà)題的所有回帖 | |||
sdzjc1988木蟲(chóng) (小有名氣)
|
[求助]
求教：LAMMPS中DNA的分子建模
|
||
| 求教, 本人想用LAMMPS做DNA的分子動(dòng)力學(xué)模擬，但不知道如何獲得DNA的data文件，請(qǐng)問(wèn)有人知道如何構(gòu)建DNA的分子模型嗎？多謝指點(diǎn)，萬(wàn)分感謝~~ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
材料考研調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
英一數(shù)一408，總分284，二戰(zhàn)真誠(chéng)求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
085410 一志愿211 22408分?jǐn)?shù)359求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
271求調(diào)劑
已經(jīng)有19人回復(fù)
-
385分 生物學(xué)（071000）求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿安徽大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)碩，331分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
318求調(diào)劑，計(jì)算材料方向
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
291求調(diào)劑
已經(jīng)有25人回復(fù)
-
一志愿北京科技大學(xué)085601材料工程英一數(shù)二初試總分335求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 薄膜在lammps條件下的諧振
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 在LAMMPS中怎么建立圖示的模型
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 尋求lammps的應(yīng)用 歡迎大家暢所欲言
已經(jīng)有8人回復(fù)
- lammps中固定鍵長(zhǎng)
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】LAMMPS-運(yùn)行報(bào)錯(cuò)
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】lammps安裝過(guò)程中，在安裝fftw的過(guò)程中遇到問(wèn)題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【討論】想學(xué)lammps是否應(yīng)該先學(xué)習(xí)C++
已經(jīng)有28人回復(fù)
- 【求助】LAMMPS、NAMD和CHARMM誰(shuí)最適合生物大分子模擬？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【討論】lammps中利用velocity命令無(wú)法控制住速度問(wèn)題
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【討論】lammps中關(guān)于fix ave/spatial命令的輸出問(wèn)題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】lammps中多元化合物的晶格創(chuàng)建問(wèn)題
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】MS建模導(dǎo)入lammps問(wèn)題求救
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】Lammps 多機(jī)并行的問(wèn)題
已經(jīng)有11人回復(fù)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sdzjc1988: 金幣+2 2012-03-23 08:40:50
zh1987hs: 金幣+3, 謝謝 2012-03-25 16:10:43
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sdzjc1988: 金幣+2 2012-03-23 08:40:50
zh1987hs: 金幣+3, 謝謝 2012-03-25 16:10:43
|
做DNA相關(guān)的模擬，推薦使用NAMD或者gromacs吧，這兩款更適合做生物分子模擬，你找找相關(guān)的文獻(xiàn)，很少用lammps做。 lammps更適合做材料相關(guān)的模擬，而且lammps處理生物分子相關(guān)的模擬的適合，很多重要的信息處理起來(lái)很麻煩，比如殘基，鏈等相關(guān)的信息。 DNA分子建模參考NAMD手冊(cè)，介紹的非常非常詳細(xì)。 http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/ Modeling Nanopores for Sequencing DNA 這部分 |
3樓2012-03-23 08:28:35
wangzg9292
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 3933
- 散金: 56
- 帖子: 348
- 在線(xiàn): 89.6小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 723844
- 注冊(cè): 2009-03-16
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
2樓2012-03-23 08:18:50
4樓2012-03-23 08:29:07
sdzjc19885樓2012-03-23 08:34:50
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料考研調(diào)劑 +3 | Gs大王 2026-04-02 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 385分 生物學(xué)（071000）求調(diào)劑 +3 | qf626 2026-04-01 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿安徽大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)碩，331分求調(diào)劑 +3 | 蔣昌鵬qtj 2026-04-01 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 286分調(diào)劑 +18 | Faune 2026-03-30 | 20/1000 |
|
|
|
[考研] 085601材料工程找調(diào)劑 +20 | oatmealR 2026-03-29 | 21/1050 |
|
|
|
[考研] 314求調(diào)劑 +4 | 溪云珂 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 350求調(diào)劑 +7 | 阿佳～ 2026-03-31 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 085601一志愿中山大學(xué)深圳材料工程330求調(diào)劑 +6 | pipiver 2026-03-30 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 330分求調(diào)劑 +11 | qzenlc 2026-03-29 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 324求調(diào)劑 +4 | 想上學(xué)求調(diào) 2026-04-01 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑一志愿北航070300，本科鄭大化學(xué) +8 | 圣日耳曼條 2026-04-01 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 一志愿北交材料工程總分358 +5 | cs0106 2026-04-01 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿武理材料工程302調(diào)劑環(huán)化或化工 +15 | Doleres 2026-03-31 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 一志愿 南京航空航天大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩 +10 | @taotao 2026-03-31 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 考研生物與醫(yī)藥調(diào)劑 +7 | 鐵憨憨123425 2026-03-31 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿南師大0703化學(xué) 275求調(diào)劑 +5 | Ripcord上岸 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 英一數(shù)一總分334求調(diào)劑 +4 | 陳陽(yáng)坤 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +13 | 是妍子也是研子 2026-03-30 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 求佛 +7 | 迷人的哈哈 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +5 | 哇盧卡庫(kù) 2026-03-26 | 5/250 |
|