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陳年芬芳

新蟲(chóng) (小有名氣)

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[求助] 同一個(gè)平板上挑的兩個(gè)菌測(cè)序，序列差很多，大家?guī)臀铱纯窗。斜葘?duì)圖！謝謝啦

4-3-1和4-3-2是一個(gè)菌斑搖菌后分裝的兩管樣品測(cè)序結(jié)果
4-2-1和4-2-2是同一個(gè)平板上另一個(gè)菌斑搖菌后分裝的兩管測(cè)序結(jié)果
91和92是引物。
四個(gè)樣品的峰圖都沒(méi)有問(wèn)題
為什么4-3這組和4-2這組的序列差這么多�。慷际峭慌陌�。
第一次碰到這種情況，以前也只是二三個(gè)堿基的差異，這次差太多了，什么原因�。�
我們這個(gè)沒(méi)有人做，也沒(méi)法和別人比對(duì)。腫么辦？

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1樓 2012-04-08 13:57:40

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陳年芬芳

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引用回帖:

3樓: Originally posted by asdf6074053 at 2012-04-09 12:53:01:
不好意思，不知怎么的就亂碼了，其實(shí)單克隆是沒(méi)必要分量管單獨(dú)測(cè)序的，除非挑克隆過(guò)程就有問(wèn)題。你是在菌長(zhǎng)了多久挑的克��？

大概14個(gè)小時(shí)吧，測(cè)兩個(gè)也是為了有保障，但是為什么兩個(gè)菌斑的結(jié)果差異這么大��？

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4樓2012-04-09 13:05:33

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asdf6074053

新蟲(chóng) (初入文壇)

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

這么低的相似性一定是有???陽(yáng)性的，為什么??是跟目的??列比對(duì)呢？而是他們相互比？而且我感覺(jué)如果挑克隆時(shí)沒(méi)問(wèn)題的??是沒(méi)必??將???克隆分兩管?????獨(dú)測(cè)??的，你的是???在平???上長(zhǎng)了多久開(kāi)始挑的？

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2樓2012-04-09 12:42:50

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asdf6074053

新蟲(chóng) (初入文壇)

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★ ★
西瓜: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2012-04-10 18:30:43

不好意思，不知怎么的就亂碼了，其實(shí)單克隆是沒(méi)必要分量管單獨(dú)測(cè)序的，除非挑克隆過(guò)程就有問(wèn)題。你是在菌長(zhǎng)了多久挑的克��？

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3樓2012-04-09 12:53:01

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hyacinth326

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
西瓜: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流~很活躍��！ 2012-04-10 18:30:58

差這么多，應(yīng)該不是一個(gè)基因在PCR過(guò)程中突變的吧，分析原因可能是模板就不單一吧，然后PCR出來(lái)的產(chǎn)物就不單一，連接之后肯定每個(gè)克隆都不一樣了。。。

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5樓2012-04-09 15:00:40

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